| Literature DB >> 34860693 |
Kevin A Brown1, Jean-Paul R Soucy2, Sarah A Buchan2, Shelby L Sturrock2, Isha Berry2, Nathan M Stall2, Peter Jüni2, Amir Ghasemi2, Nicholas Gibb2, Derek R MacFadden2, Nick Daneman1.
Abstract
Entities:
Mesh:
Year: 2021 PMID: 34860693 PMCID: PMC8248458 DOI: 10.1503/cmaj.210132-f
Source DB: PubMed Journal: CMAJ ISSN: 0820-3946 Impact factor: 8.262
Positivité des tests de SRAS-CoV-2, taux de croissance des cas et mobilité hebdomadaires au Canada du 15 mars 2020 au 6 mars 2021
| Niveau d’analyse | Nbre de semaines | Nbre de cas | Médiane (EI) | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Positivité des tests, % | Taux de croissance des cas | Taux de croissance corrigé en fonction de la positivité | Mobilité hors domicile, % des valeurs de référence | |||
| Canada | 51 | 888 751 | 3,7 (1,2–6,1) | 1,0 (0,9–1,2) | 1,1 (0,7–1,5) | 61 (48–73) |
| Période | ||||||
| Mars 2020 | 3 | 14 149 | 4,1 (2,7–5,6) | 4,0 (3,0–4,7) | 8,7 (6,1–11,3) | 82 (71–89) |
| Avril–juin 2020 | 13 | 92 650 | 3,9 (1,4–6,0) | 1,0 (0,8–1,1) | 0,8 (0,5–1,1) | 40 (31–52) |
| Juillet–septembre 2020 | 13 | 59 643 | 0,9 (0,8–1,1) | 1,2 (1,0–1,3) | 1,3 (1,0–1,7) | 75 (73–77) |
| Octobre–décembre 2020 | 13 | 423 081 | 5,9 (4,0–6,3) | 1,1 (1,0–1,2) | 1,3 (1,1–1,4) | 65 (60–67) |
| Janvier–mars 2021 | 9 | 299 228 | 4,5 (3,7–6,2) | 0,9 (0,8–1,0) | 0,8 (0,7–0,9) | 48 (45–50) |
| Provinces | ||||||
| Alberta | 51 | 135 498 | 2,1 (1,1–4,6) | 1,1 (0,9–1,4) | 1,0 (0,7–1,9) | 63 (52–78) |
| Colombie-Britannique | 51 | 83 034 | 2,3 (1,2–5,6) | 1,0 (0,9–1,3) | 1,0 (0,9–1,5) | 62 (56–73) |
| Manitoba | 32 | 31 785 | 5,7 (2,1–9,4) | 1,0 (0,8–1,4) | 1,1 (0,7–1,8) | 64 (52–82) |
| Ontario | 51 | 311 810 | 2,3 (0,9–3,8) | 1,1 (0,9–1,2) | 1,1 (0,7–1,4) | 57 (40–66) |
| Québec | 50 | 289 583 | 9,1 (2,3–14,7) | 1,0 (0,8–1,2) | 1,0 (0,6–1,6) | 60 (45–73) |
| Saskatchewan | 44 | 29 299 | 2,3 (1,1–15,6) | 1,1 (0,9–1,3) | 1,2 (0,8–1,8) | 68 (61–87) |
Remarque : EI = écart interquartile, SRAS-CoV-2 = coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2.
Deux semaines manquantes pour la positivité des tests au niveau national (n = 49) et 10 au niveau provincial (n = 269).
Figure 1:Mobilité hors domicile (A) au Canada et (B) dans 6 provinces canadiennes du 5 février 2020 au 6 mars 2021. Remarque : L’indice de mobilité hors domicile est une mesure de la durée moyenne passée hors domicile selon les données de mobilité des téléphones intelligents (indice mis à l’échelle de façon à ce que les niveaux de la période de référence [du 3 janvier au 6 février 2020] représentent 100 %). Les valeurs indices sont lissées à l’aide d’une spline pénalisée, avec un nœud pour chaque période de 2 semaines (ligne en gras), et superposées à une moyenne mobile de 7 jours (ligne pâle).
Facteurs ayant influé sur les taux de croissance hebdomadaires des cas de SRAS-CoV-2 et les taux de croissance hebdomadaires corrigés en fonction de la positivité au Canada entre le 15 mars 2020 et le 6 mars 2021
| Variable | Niveau national | Niveau provincial | ||
|---|---|---|---|---|
| Non ajustée | Ajustée | Non ajustée | Ajustée | |
| Coefficients, RTC (IC à 95 %) | ||||
| Mobilité hors domicile moyenne des 3 semaines précédentes, par augmentation de 10 % | 1,19 (1,13–1,24) | 1,25 (1,20–1,29) | 1,16 (1,12–1,20) | 1,20 (1,16–1,24) |
| Température, par augmentation de 5 ºC | 0,83 (0,75–0,93) | 0,88 (0,86–0,91) | ||
| Caractéristiques des modèles | ||||
| Autocorrélation résiduelle | 0,14 | 0,15 | 0,20 | 0,09 |
| Complexité des modèles (degrés de liberté) | 7,8 | 7,5 | 23,9 | 15,6 |
| Qualité de l’ajustement, | 81,8 | 81,6 | 33,3 | 38,2 |
| Critère d’ajustement des modèles (AIC) | −28,8 | −28,9 | 242,1 | 204,1 |
| Coefficients, RTC (IC à 95 %) | ||||
| Mobilité hors domicile moyenne des 3 semaines précédentes, par augmentation de 10 % | 1,27 (1,10–1,47) | 1,35 (1,17–1,55) | 1,13 (1,08–1,19) | 1,29 (1,21–1,38) |
| Température, par augmentation de 5 ºC | 0,73 (0,56–0,94) | 0,89 (0,84–0,94) | ||
| Caractéristiques des modèles | ||||
| Autocorrélation résiduelle | 0,04 | 0,03 | 0,15 | 0,10 |
| Complexité des modèles (degrés de liberté) | 7,8 | 8,2 | 3,0 | 15,0 |
| Qualité de l’ajustement, | 54,4 | 56,2 | 9,7 | 15,6 |
| Critère d’ajustement des modèles (AIC) | 34,6 | 33,3 | 509,0 | 490,5 |
Remarque : AIC = Akaike’s Information Criterion (AIC le plus faible préférablement), IC = intervalle de confiance, RTC = rapport des taux de croissance, SRAS-CoV-2 = coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2.
Pour les modèles de croissance hebdomadaires corrigés en fonction de la positivité, il manque 2 semaines à l’échelle nationale (n = 49) et 10 à l’échelle provinciale (n = 269).
Le modèle non ajusté incluait la mobilité hors domicile des 3 semaines précédentes et une spline pénalisée pour la semaine.
Le modèle ajusté incluait la mobilité hors domicile des 3 semaines précédentes, une spline pénalisée pour la semaine et la température moyenne des 3 semaines précédentes.
Figure 2:Lien ajusté entre la mobilité hors domicile et le taux de croissance des cas de coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans 6 provinces canadiennes entre le 15 mars 2020 et le 6 mars 2021. Le taux de croissance hebdomadaire des cas de SRAS-CoV-2 (nombre de cas d’une semaine donnée/semaine précédente) est étroitement lié à la mobilité hors domicile des 3 semaines précédentes. Dans l’analyse ajustée au niveau canadien, chaque augmentation de 10 % de la mobilité hors domicile a été associée à une augmentation de 25 % du taux de croissance (rapport des taux de croissance [RTC] 1,25, intervalle de confiance [IC] à 95 % 1,20–1,29). Dans l’analyse provinciale ajustée, chaque augmentation de 10 % de la mobilité a été associée à une augmentation de 20 % du rapport des taux de croissance (RTC 1,20, IC à 95 % 1,16–1,24). Les associations sont représentées en pointillé.
Figure 3:Variation de la moyenne mobile de la mobilité sur 3 semaines (points de couleur), seuil de mobilité estimé (ligne noire) et intervalles de confiance à 80 % (zone ombrée) pour (A) le Canada et (B) 6 provinces canadiennes. La taille des cercles est proportionnelle au nombre de cas dans une semaine donnée. Remarque : Le seuil de mobilité est le niveau estimé de mobilité requis pour maîtriser la croissance des cas de coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2). Ce seuil est plus élevé l’été et plus bas dans les provinces plus populeuses, particulièrement en Ontario (médiane 50 %) et au Québec (médiane 54 %). Lorsque la mobilité est passée sous le seuil de mobilité au printemps 2020 et à l’hiver 2021, le nombre de cas hebdomadaires de SRAS-CoV-2 a diminué. À la fin novembre 2020, le Manitoba était la seule province à avoir franchi avec succès le seuil de mobilité, ce qui a entraîné des réductions de la croissance des cas de SRAS-CoV-2. Les autres provinces n’ont atteint ce seuil qu’à la fin décembre 2020 ou au début janvier 2021.