Literature DB >> 28641698

[Expression of Serum LncRNA HOTAIR in Non-small Cell Lung Cancer 
and Its Clinical Significance].

Nan Tan1, Lihong Li1, Lu Bai1, Kun Zhao1.   

Abstract

BACKGROUND: The expression of long noncoding RNA HOX antisense RNA (HOTAIR) is abnormal in a variety of tumors. The aim of this study is to explore the serum levels and clinical significance of HOTAIR in patients with non-small cell lung cancer (NSCLC).
METHODS: The serum levels of HOTAIR were detected by real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR) in 64 NSCLC patients and 64 normal controls. The relationships between the serum levels of HOTAIR and clinical pathological parameters were analyzed.
RESULTS: Compared with normal controls, the serum levels of HOTAIR in patients with NSCLC increased significantly (P<0.01). The serum levels of HOTAIR were correlated with tumor size, tumor-node-metastasis (TNM) stage and lymph node metastasis (P<0.05), but not with age, gender, smoking, differentiation and histology (P>0.05).
CONCLUSIONS: The serum levels of HOTAIR in patients with NSCLC are significantly higher, and HOTAIR may be involved in the pathogenesis of NSCLC.

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Year:  2017        PMID: 28641698      PMCID: PMC5973358          DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2017.06.06

Source DB:  PubMed          Journal:  Zhongguo Fei Ai Za Zhi        ISSN: 1009-3419


肺癌是起源于支气管粘膜或腺体的恶性肿瘤,是发病率和死亡率增长最快、对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一,根据统计肺癌的年发病人数及年死亡人数均居全球肿瘤首位[。肺癌的发病机制尚未完全明确,可能与吸烟、职业、环境接触、电离辐射、既往肺部慢性感染、遗传及大气污染等因素有关,肺癌的早期症状不明显,甚至可无任何不适,因此研究肺癌的发病机制及早期诊断对肺癌的治疗及预后至关重要。长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是在表观遗传、转录以及转录后等多种层面上调控基因的表达水平[,研究证实lncRNA广泛参与了细胞增殖、分化及凋亡等过程,在多种疾病病理过程中发挥重要作用[,与肿瘤的发病、转移、预后及治疗密切相关[。HOX转录反义RNA(HOX transcript antisense RNA, HOTAIR)是一种新近发现具有反式转录调控作用的lncRNA[,国内外研究[发现HOTAIR在肺癌组织中高表达,且与肺癌的临床分期、淋巴结转移及预后有关。为了进一步研究HOTAIR在肺癌诊断及预后中的作用,本实验采用实时定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者血清中HOTAIR水平,并分析其与临床病理参数之间的关系。

资料与方法

病例资料

选取西安市第一医院2016年1月-2016年11月期间经过组织病理确诊的NSCLC患者64例,其中男性38例,女性26例,年龄32岁-75岁,平均(56.4±10.7)岁,组织病理类型为鳞癌23例、腺癌39例、大细胞癌2例,分期采用2009年国际抗癌联盟(Union for International Cancer Control, UICC)(第7版)肺癌肿瘤-淋巴结-转移(tumor-node-metastasis, TNM)分期标准进行:Ⅰ期15例,Ⅱ期20例,Ⅲ期26例,Ⅳ期3例。64例健康体检者作为正常对照组,其中男性40例,女性24例,年龄26岁-71岁,平均(53.4±9.6)岁,本研究经过医院伦理委员会批准并征得所有研究对象的知情同意。

样本采集

所有患者均在进行手术、化疗或放疗前进行采样,空腹无菌采取静脉血5.0 mL,放置30 min后1, 200 g离心10 min,吸取上清至离心管中,4 ℃ 12, 000 g再离心10 min后分离上清至新的离心管中,取250 μL血清加入750 μL TRIzol® LS试剂后-80 ℃保存待用。

总RNA提取及cDNA第一链合成

参照文献[严格按照TRIzol® LS试剂(美国Invitrogen公司)说明书进行血清总RNA提取,提取的RNA溶于DEPC处理的水中。采用逆转录试剂盒(美国Thermo Scientific公司)进行cDNA第一链合成,具体如下:3 μg总RNA、5 μg/μL Oligo(dT)1 μL温和混合后70 ℃孵育5 min,冰上冷却,短暂离心收集上清;依次加入5×反应缓冲液4 μL、20 U/μL RNase抑制剂1 μL及10 mmol/L dNTP 2 μL 37 ℃温和混合后孵育5 min;加入200 U/μL M-MuLV逆转录酶1 μL,42 ℃ 60 min、70 ℃ 10 min,冰上冷却终止反应;合成的cDNA第一链在-20 ℃保存待用。

实时定量PCR检测

根据Genebank中HOTAIR及内参GAPDH的序列,利用Primer 5.0软件设计引物,具体序列如下:HOTAIR上游引物5'-GGCAGCACAGAGCAACTCTA-3',下游引物5'-GCAGGGTCCCACTGCATAAT-3',扩增产物大小125 bp;GAPDH上游引物5'-ACTAGGCGCTCACTGTTCTCT-3',下游引物5'-GTTGACTCCGACCTTCACCT-3',扩增产物大小83 bp,由上海生工生物技术科技有限公司合成引物。利用SYBR® Premix Ex TaqTM Ⅱ(大连宝生物工程有限公司)进行PCR扩增,20 μL反应体系包括10 μL SYBR® Premix Ex TaqTM Ⅱ(2×)、模板3.0 μL、上下游引物(10 μM)各1.0 μL、ddH2O 5.0 μL,PCR反应条件:95 ℃预变性30 s,95 ℃ 10 s、60 ℃ 30 s共35个循环。扩增结束后得到Ct值,采用2-△△Ct法计算血清中HOTAIR的表达水平。

统计学方法

所有数据均采用SPSS 16.0进行统计学处理,计量资料采用均数±标准差(Mean±SD)表示,组间比较采用t检验,以P < 0.05为差异有统计学意义。

结果

HOTAIR在NSCLC患者血清中的水平

实时定量PCR检测结果发现NSCLC患者血清中HOTAIR水平为(2.85±1.16),明显高于正常对照组(1.74±0.69),两组之间差异具有统计学意义(t=6.566, P < 0.01)。

NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数之间的关系

为了进一步研究HOTAIRNSCLC发生、发展中的作用,本研究统计分析了肺癌血清中HOTAIR水平与临床病理参数之间的关系,结果发现血清中HOTAIR水平与患者性别、年龄、吸烟、分化程度及病理类型均无明显相关(P > 0.05)。而肿瘤大小 > 3 cm的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于肿瘤大小≤3 cm患者,Ⅲ期+Ⅳ期肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于Ⅰ期+Ⅱ期患者,有淋巴转移的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于无淋巴转移的患者,差异均具有统计学意义(P < 0.05),结果见表 1。
1

NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数的关系

The relationships between the serum levels of HOTAIR and clinical pathological parameters in the patients with NSCLC

Clinical pathological parametersCases (n)Relative expression of HOTAIR(Mean±SD)tP
a: 2 cases of large cell carcinoma were not counted. NSCLC: non-small cell lung cancer; HOTAIR: HOX antisense RNA. TNM: tumor-node-metastasis.
Age (yr)0.7750.221
  > 65173.04±1.28
  ≤65472.78±1.15
Gender0.3330.739
  Male382.81±1.15
  Female262.91±1.22
Smoking0.5310.298
  Yes302.94±1.24
  No342.78±1.17
Tumor size2.4330.009
  > 3 cm363.17±1.33
  ≤3 cm282.42±1.07
TNM stage2.5390.007
  Ⅰ+Ⅱ352.49±1.13
  Ⅲ+Ⅳ293.28±1.36
Differentiation1.0290.154
  Well/Moderate402.73±1.17
  Poor243.05±1.26
Lymph node metastasis2.9800.002
  Negative272.34±0.97
  Positive373.22±1.29
Histologya
  Squamous cell carcinoma232.67±1.180.8960.187
  Adencarcinoma392.96±1.25
NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数的关系 The relationships between the serum levels of HOTAIR and clinical pathological parameters in the patients with NSCLC

讨论

非编码RNA(non-coding RNA)是指不编码蛋白质的RNA,其中包括rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、microRNA、lncRNA及circRNA。由于lncRNA不编码蛋白质,最初被认为是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能。但随着RNA测序、芯片等分子生物学技术和生物信息学的不断发展,越来越多的研究[证实lncRNA具有复杂的生物学功能,在多个层面上参与细胞分化和个体发育调控,并与多种疾病尤其是恶性肿瘤的发生发展密切相关。国内外学者研究[发现MALAT1、ANRIL、H19、MEG3、GAS5及CCAT2等多种lncRNAs在肺癌中异常表达,与肺癌的发病、诊断、治疗及预后密切相关。HOTAIR是Rinn等[发现的第一个具有反式转录调控作用的lncRNA,人HOTAIR基因定位于12q13区域,基因(RefSeq NR_003716)全长2, 364 bp,由1个长外显子和5个短外显子组成,HOTAIR主要是通过5'结构域和3'结构域募集复杂蛋白复合体来调控靶基因的表达。多项研究发现HOTAIR不仅在乳腺癌、食管癌、胃癌、肝癌、结肠癌、肾癌、宫颈癌、卵巢癌、胰腺癌、肺癌等实体瘤中高表达[,而且在淋巴瘤、急性白血病等血液系统恶性肿瘤中也高表达[。国内外学者[研究发现NSCLC患者肿瘤组织中的HOTAIR的表达水平明显高于正常肺组织,细胞实验证实过表达HOTAIR可以显著促进A549细胞的迁移和侵袭,且与顺铂化疗耐药有关。由于lncRNA具有疾病特异性和组织特异性、稳定性高等特点,在心血管疾病、肿瘤患者外周循环中可以检测到lncRNA,有可能成为疾病诊断、预后的标志物[。本研究采用实时定量PCR检测NSCLC患者血清中HOTAIR的水平,结果发现NSCLC患者血清中HOTAIR水平明显高于正常对照组(P < 0.01),这与国内外学者在肺癌组织中的研究结果一致[,提示HOTAIRNSCLC病理过程中发挥了重要作用。 本研究进一步分析了NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数之间的关系,结果发现肿瘤大小 > 3 cm的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于肿瘤大小≤3 cm患者,Ⅲ期+Ⅳ期肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于Ⅰ期+Ⅱ期患者,提示HOTAIRTNM分期及肿瘤负荷有关,与国内外学者研究结果[一致,本研究还发现Ⅰ期+Ⅱ期患者血清中HOTAIR水平仍然明显高于正常对照组(P < 0.01),随着研究的不断深入HOTAIR有可能成为肺癌的早期诊断指标之一。同时研究结果还发现有淋巴转移的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于无淋巴转移的患者,有研究表明过表达HOTAIR可以显著促进肺癌细胞A549的迁移和侵袭[,提示HOTAIR参与了肺癌的侵袭及转移过程。本研究结果显示肺癌患者血清中HOTAIR水平与患者性别、年龄、吸烟、分化程度及病理类型均无明显相关,但张泽雨[等发现NSCLC患者肿瘤组织中HOTAIR的水平与肿瘤的分化程度明显相关,这可能与病例的选择有关,有待于扩大样本量进行进一步研究。 综上所述,本研究发现NSCLC患者血清中HOTAIR水平升高,且与肿瘤大小、TNM分期及淋巴转移有关,提示HOTAIR与肺癌的发生发展及转移有关,但其具体作用机制尚不明确。由于肺癌的临床表现比较复杂,早期症状不明显,甚至可无任何不适,因此肺癌的早期诊断尤为重要,随着对HOTAIR研究的不断深入,可能为肺癌的早期诊断及治疗提供新的靶点。
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Review 1.  Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function.

Authors:  Jeffrey J Quinn; Howard Y Chang
Journal:  Nat Rev Genet       Date:  2016-01       Impact factor: 53.242

Review 2.  Potential of long non-coding RNAs in cancer patients: From biomarkers to therapeutic targets.

Authors:  Subash Chandra Gupta; Yashoda Nandan Tripathi
Journal:  Int J Cancer       Date:  2016-12-30       Impact factor: 7.396

Review 3.  Roles for long non-coding RNAs in physiology and disease.

Authors:  Maria-Theodora Melissari; Phillip Grote
Journal:  Pflugers Arch       Date:  2016-03-05       Impact factor: 3.657

4.  Overexpression of long non-coding RNA HOTAIR predicts a poor prognosis in patients with acute myeloid leukemia.

Authors:  Shenghao Wu; Cuiping Zheng; Songyan Chen; Xiaoping Cai; Yuejian Shi; Bijing Lin; Yuemiao Chen
Journal:  Oncol Lett       Date:  2015-07-30       Impact factor: 2.967

Review 5.  Circulating Noncoding RNAs as Biomarkers of Cardiovascular Disease and Injury.

Authors:  Janika Viereck; Thomas Thum
Journal:  Circ Res       Date:  2017-01-20       Impact factor: 17.367

6.  Long noncoding RNA HOTAIR, a hypoxia-inducible factor-1α activated driver of malignancy, enhances hypoxic cancer cell proliferation, migration, and invasion in non-small cell lung cancer.

Authors:  Chunxia Zhou; Lincai Ye; Chuan Jiang; Jie Bai; Yongbin Chi; Haibo Zhang
Journal:  Tumour Biol       Date:  2015-06-19

Review 7.  A pathophysiological view of the long non-coding RNA world.

Authors:  Federico Di Gesualdo; Sergio Capaccioli; Matteo Lulli
Journal:  Oncotarget       Date:  2014-11-30

Review 8.  [Progress of Long Non-coding RNAs in Non-small Cell Lung Cancer].

Authors:  Liming Fan; Zhidong Hu
Journal:  Zhongguo Fei Ai Za Zhi       Date:  2016-02

Review 9.  Functions of lncRNA HOTAIR in lung cancer.

Authors:  Gregory Loewen; Janarthanan Jayawickramarajah; Ying Zhuo; Bin Shan
Journal:  J Hematol Oncol       Date:  2014-12-10       Impact factor: 17.388

10.  Elevated RNA expression of long non‑coding HOTAIR promotes cell proliferation and predicts a poor prognosis in patients with diffuse large B cell lymphoma.

Authors:  Yuling Yan; Jingyin Han; Zhenqing Li; Honglan Yang; Yanmin Sui; Minglin Wang
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