Literature DB >> 25887931

[Use of molecular test for adenovirus detection between different pediatric patients].

Terezinha Maria de Paiva1.   

Abstract

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Year:  2015        PMID: 25887931      PMCID: PMC4516364          DOI: 10.1016/j.rpped.2015.03.005

Source DB:  PubMed          Journal:  Rev Paul Pediatr        ISSN: 0103-0582


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The evolution of the methodologies used in the diagnosis of acute respiratory infections of viral etiology is due to the advancement of molecular biology, immunology, genetics and biotechnology. The development of the in vitro cell culture1 resulted in the isolation of viruses associated with acute respiratory infection of the respiratory tract (respiratory syncytial virus, adenovirus and parainfluenza virus). The discovery of the molecular structure of nucleic acids2 contributed to the development of molecular genetics, responsible, among other things, for the improvement of molecular diagnosis of infectious diseases in the late twentieth century, as well as the disclosure of new viral etiologies related to acute respiratory infection in the first decades of the 21st century. By the end of the 1980s, the diagnosis of respiratory infection consisted in the isolation of the virus in cell cultures and serology. The great challenge faced by scientists at the time was to enhance diagnostic methodologies, aiming to address the appropriate strategies for disease prevention and control; i.e., to establish methodologies that would allow attaining fast and specific diagnoses.3 Considering the impact of infection by respiratory viruses in all age groups, especially among children <5 years of age, patients with chronic diseases and adults ≥60 years of age,3 , 4 a rapid diagnosis is important for: antiviral use; respiratory disease etiology clarification; considering prescription of antibiotics; knowing the natural history of the virus and its physiopathology, which helps to understand the possible complications that may occur depending on the infection characteristics; assessment of disease containment through quarantine; measuring the hospitalization period; preventing unnecessary laboratory investigations, and dispensing with inappropriate isolation of non-infected individuals.5 , 6 The development of monoclonal antibodies in the 1970s7 contributed to the development of a specific antibody panel for influenza virus types A and B, RSV, ADV, and PIV 1, 2 3, which allows the fast and specific identification by direct or indirect immunofluorescence of the seven respiratory viruses. The advent of molecular methodologies, starting in the 1980s,8 of which principle resides on the Polymerase Chain Reaction (PCR), allowing the amplification of conserved genome targets of different etiological agents, revolutionized the understanding of epidemiology, diagnosis and research of infectious diseases of viral etiology, among other approaches. Currently, there are several fast and specific diagnostic methods, using both the principle of immunofluorescence with monoclonal antibodies and molecular methods, for simultaneous identification of different viruses.9 , 10 In this issue of Revista Paulista de Pediatria, Puerari et al.11 assessed the performance of both methods, using a method that allows simultaneous identification of the seven respiratory viruses by direct immunofluorescence and molecular diagnosis using Nested Polymerase Chain Reaction nested PCR, aiming at the investigation of adenovirus in respiratory secretions collected from children with congenital heart disease and children from the community with acute respiratory infection (ARI). This phase of the research did not include the analysis of other respiratory viruses; however, it showed that the molecular methodology was more sensitive for the detection of adenovirus in different groups of children, when compared to immunofluorescence. Due to the sensitivity in the detection of nucleic acids by nested PCR reported in the present analysis, the authors recommend routine surveillance in patients with congenital heart disease by molecular methods, considering the efficiency in the etiological agent detection, especially the diagnostic flow performance. In this context, investment in research for the development of antiviral agents for noninfluenza respiratory viruses, as well as to obtain knowledge on the molecular epidemiology of different respiratory viruses in the community is of utmost importance, as it will yield important information regarding the infection of hospitalized patients and of patients with chronic diseases by different viruses that affect the respiratory tract.12 To date, no antiviral drug has been approved against adenoviruses, which are well known for their capacity to cause severe disease, particularly in immunosuppressed patients. Recent clinical studies have assessed the oral formulation of the antiviral brincidofovir as a promising treatment for patients belonging to risk groups and infected by adenoviruses.13 The evolution of diagnostic methodologies potentiates researches aiming at the creation of antiviral agents and their timely intervention, providing better quality of life and consequent advances in the field of Public Health. A evolução das metodologias usadas no diagnóstico das infecções respiratórias agudas de etiologia viral é consequência do avanço dos estudos de biologia molecular, imunologia, genética e biotecnologia. O desenvolvimento da cultura de células in vitro 1 possibilitou o isolamento dos vírus associados à infecção respiratória aguda do trato respiratório (vírus respiratório sincicial, adenovírus e os vírus da parainfluenza). A descoberta da estrutura molecular dos ácidos nucléicos 2 contribuiu para o desenvolvimento da genética molecular, responsável, entre outras aplicações, pelo aprimoramento do diagnóstico molecular das doenças infecciosas no fim do século XX e a revelação de novas etiologias virais envolvidas em quadros de infecção respiratória aguda nas primeiras décadas do século XXI. Até o fim da década de 1980, o diagnóstico da infecção respiratória consistia no isolamento do vírus em cultura de células e sorologia. O grande desafio dos cientistas, na época, era aprimorar as metodologias diagnósticas com vistas a contemplar as estratégias oportunas de prevenção e controle da doença; ou seja, viabilizar metodologias de diagnóstico rápido e específico.3 Considerando o impacto da infecção pelos vírus respiratórios em todas as faixas etárias, sobretudo em crianças menores de cinco anos, portadores de doenças crônicas e adultos na faixa etária de 60 anos ou mais,3 and 4 o diagnóstico rápido é relevante para: uso de antivirais; esclarecer a etiologia da doença respiratória; ponderar a prescrição de antibióticos; conhecer a história natural do vírus e sua fisiopatologia que contribui para o entendimento das possíveis complicações que possam ocorrer em função das características da infecção; avaliação de contenção da doença pela quarentena; mensurar o período de hospitalização; evitar investigações laboratoriais desnecessárias; dispensar o isolamento inoportuno de indivíduos não infectados.5 and 6 O desenvolvimento dos anticorpos monoclonais na década de 19707 contribuiu para a elaboração de painel de anticorpos específicos para os vírus da influenza tipos A e B, VRS, ADV, PF 1, 2 e 3, o que permite a identificação rápida e específica pela imunofluorescência direta ou indireta dos sete vírus respiratórios. O advento de metodologias moleculares, a partir da década de 1980,8 cujo princípio reside na reação em cadeia da polimerase polimerase chain reaction (PCR) -, que permite a amplificação de alvos conservados do genoma de diferentes agentes etiológicos, revolucionou o conhecimento da epidemiologia, o diagnóstico e a pesquisa das doenças infecciosas de etiologia viral, entre outras abordagens. Atualmente, há diferentes modalidades de diagnóstico rápido e específico que usam tanto o princípio da imunofluorescência com anticorpos monoclonais quanto os métodos moleculares na identificação simultânea de vários vírus. 9 and 10 Neste fascículo da Revista Paulista de Pediatria, Puerari et al.11 avaliaram o desempenho de ambas as metodologias no formato que permite a identificação simultânea dos sete vírus respiratórios, pela imunofluorescência direta, e o diagnóstico molecular no formato nested polymerase chain reaction (nested PCR), com vistas à investigação de adenovírus em secreções respiratórias colhidas de crianças portadoras de cardiopatia congênita e crianças da comunidade com quadro de infecção respiratória aguda (IRA). Essa fase da investigação não contemplou a análise de outros vírus respiratórios; no entanto, revelou que a metodologia molecular foi mais sensível para a detecção de adenovírus nos diferentes grupos de crianças, quando comparada à imunofluorescência. Em função da sensibilidade na detecção de ácidos nucléicos pela nested PCR, constatada na presente avaliação, os autores recomendam a vigilância de rotina em pacientes portadores de cardiopatia congênita por métodos moleculares, tendo em vista a eficiência na detecção do agente etiológico, sobretudo a condução do fluxo diagnóstico. Nesse contexto, o investimento em pesquisas para o desenvolvimento de antivirais para os vírus respiratórios não influenza e para o conhecimento da epidemiologia molecular dos diferentes vírus respiratórios na comunidade é de fundamental importância, uma vez que contribuirá com informações relevantes quanto à infecção de pacientes hospitalizados e portadores de doenças crônicas pelos diferentes vírus que acometem o trato respiratório.12 Até o presente, não há uma droga antiviral aprovada contra os adenovírus, reconhecidos pela sua capacidade de desenvolver quadros graves da doença, principalmente em pacientes imunossuprimidos. Estudos clínicos recentes avaliam a formulação oral do brincidofovir como um antiviral promissor para o tratamento de pacientes de grupos de risco infectados pelos adenovírus.13 A evolução das metodologias diagnósticas potencializa as pesquisas com vistas à geração de antivirais e sua intervenção oportuna e proporciona a melhoria na qualidade de vida e os consequentes avanços na área da saúde pública.
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1.  Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity.

Authors:  G Köhler; C Milstein
Journal:  Nature       Date:  1975-08-07       Impact factor: 49.962

2.  Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid.

Authors:  J D WATSON; F H CRICK
Journal:  Nature       Date:  1953-04-25       Impact factor: 49.962

3.  Production of hemagglutinin by mumps and influenza A viruses in suspended cell tissue cultures.

Authors:  T H WELLER; J F ENDERS
Journal:  Proc Soc Exp Biol Med       Date:  1948-10

4.  The unusual origin of the polymerase chain reaction.

Authors:  K B Mullis
Journal:  Sci Am       Date:  1990-04       Impact factor: 2.142

Review 5.  The role of multiplex PCR in respiratory tract infections in children.

Authors:  Jens Christian Krause; Marcus Panning; Hartmut Hengel; Philipp Henneke
Journal:  Dtsch Arztebl Int       Date:  2014-09-19       Impact factor: 5.594

6.  Cost-effectiveness of rapid diagnosis of viral respiratory tract infections in pediatric patients.

Authors:  P C Woo; S S Chiu; W H Seto; M Peiris
Journal:  J Clin Microbiol       Date:  1997-06       Impact factor: 5.948

7.  [Application of molecular assay for adenovirus detection among different pediatric patients].

Authors:  Diane Puerari; Clarice Camargo; Sandra Gratura; Aripuanã Sakurada Aranha Watanabe; Celso Granato; Nancy Cristina Junqueira Bellei
Journal:  Rev Paul Pediatr       Date:  2015-03-28

Review 8.  Rapid point of care diagnostic tests for viral and bacterial respiratory tract infections--needs, advances, and future prospects.

Authors:  Alimuddin Zumla; Jaffar A Al-Tawfiq; Virve I Enne; Mike Kidd; Christian Drosten; Judy Breuer; Marcel A Muller; David Hui; Markus Maeurer; Matthew Bates; Peter Mwaba; Rafaat Al-Hakeem; Gregory Gray; Philippe Gautret; Abdullah A Al-Rabeeah; Ziad A Memish; Vanya Gant
Journal:  Lancet Infect Dis       Date:  2014-09-01       Impact factor: 25.071

Review 9.  Surveillance for emerging respiratory viruses.

Authors:  Jaffar A Al-Tawfiq; Alimuddin Zumla; Philippe Gautret; Gregory C Gray; David S Hui; Abdullah A Al-Rabeeah; Ziad A Memish
Journal:  Lancet Infect Dis       Date:  2014-09-01       Impact factor: 25.071

Review 10.  Advances in antivirals for non-influenza respiratory virus infections.

Authors:  Frederick G Hayden
Journal:  Influenza Other Respir Viruses       Date:  2013-11       Impact factor: 4.380

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