Literature DB >> 35183067

[Nirmatrelvir plus ritonavir (Paxlovid) a potent SARS-CoV-2 3CLpro protease inhibitor combination].

J Reina1, C Iglesias.   

Abstract

All coronavirus, including SARS-CoV-2, encode two proteases needed for the processing of PP1A and PP1AB polyproteins. The main protease 3CL (chemotripsine-like) gives rise to the formation of NSP11/16 proteins. The 3CL protease has been constituted as one of the possible therapeutic targets for the development of antiviral drugs against SARS-COV-2 due to its highly conserved sequence and structure among all coronaviruses. During the SARS-COV-1 pandemic, a hydroxymethyl ketone derivative (PF-00835231) was identified with an intense inhibitory activity against the 3CL protease. Subsequent chemical modifications gave rise to derivative PF-07321332 (nirmatrelvir) which has shown a high antiviral efficacy against SARS-COV-2. The company's data indicate that it is capable of reducing 89% the risk of hospitalization and death of patients infected with hardly adverse effects. Its effectiveness improves if it is administered orally in the first 24-48 hours and the duration of treatment has been established between 3-5 days. The commercial form has been associated with the antiviral ritonavir that has shown the metabolism of nirmatrelvir, lengthening its average life. This antiviral would be effective against current and future viral variants, since 3CL is not modified in them. The FDA approved this antiviral in November 2021 and EMA is in the final evaluation phase. ©The Author 2022. Published by Sociedad Española de Quimioterapia. This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/).

Entities:  

Keywords:  Nirmatrelvir; PF-07321332; Paxlovid; SARS-CoV-2; antiviral

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Substances:

Year:  2022        PMID: 35183067      PMCID: PMC9134883          DOI: 10.37201/req/002.2022

Source DB:  PubMed          Journal:  Rev Esp Quimioter        ISSN: 0214-3429            Impact factor:   2.515


INTRODUCCIÓN

Tras la emergencia y pandemia del SARS-CoV-2 se estableció la necesidad urgente de desarrollar fármacos antivirales específicos frente al mismo y plataformas vacunales de elevada eficacia. En estos momentos las vacunas han ganado la batalla frente a los antivirales, sin embargo éstos últimos serán una herramienta esencial en el control de la pandemia [1,2]. Los últimos datos comunicados por el directorio ClinicalTrials.gov muestran la existencia de 4.371 estudios basados en múltiples antivirales frente al SARS-CoV-2 [3]. A pesar de ello, sólo algunos ya han alcanzado la fase clínica final como molnupiravir (LagevrioTM), un análogo ribonucleósido de la citidina [4], auto-rizado por la Agencia Europea del Medicamente en noviembre de 2021 [5], y alguno de los derivados de la hidroximetilcetona, como nirmatrelvir (PF-07321332), que ha obtenido recientemente una autorización de emergencia por esta misma agencia (16 de diciembre de 2021) [6].

EL SARS-COV-2 Y LAS PROTEASAS

Todos los coronavirus, incluido el SARS-CoV-2, se caracterizan por presentar un genoma de ARN de una sola cadena (de unos 30.000 nucleótidos) de tipo ARN-mensajero (con un extremo 5´-Cap y un extremo 3´-poliA), es decir de tipo positivo. A diferencia de otros virus ARN se transcriben dando lugar a una poliproteína de una sola cadena (virus monocistrónico) que precisa ser hidrolizada por las proteasas virales, dando lugar a cada una de las diferentes proteínas que lo constituyen [7,8]. El SARS-CoV-2 produce a partir de zona replicativa dos poliproteínas solapadas derivadas de los ORF1a y ORF1b designadas como pp1a (nsp1-nsp11) y pp1ab (nsp1-16). Estas proteínas son inicialmente procesadas por dos proteasas de cisteína virales específicas designadas como proteasa papaína-like (PLpro) (nsp3) y proteasa quimotripsina-like (3CLpro o main proteasa, Mpro) (nsp5) dando lugar a unas 11-16 proteínas intermediarias y no estructurales, incluyendo a la ARN-polimerasa ARN-dirigida (nsp12) La PLpro da lugar a las proteínas nsp1-4 y la 3CLpro a las proteínas nsp5-11/16 (Figura 1) [9,10].
Figura 1

Estructura esquemática del genoma del SARS-CoV-2, proteasas y puntos de corte de las mismas (modificado de Zhu et al.[14]).

Estructura esquemática del genoma del SARS-CoV-2, proteasas y puntos de corte de las mismas (modificado de Zhu et al.[14]). La proteasa PLpro, está formada por 1.945 aminoácidos, determina la deubiquitinación de las proteínas celulares como el factor regulador 3 del interferón (IRF3), así como también inactiva el factor nuclear NF-kB que aumenta la respuesta celular de las células B (inmunidad humoral) [10]. La proteasa 3CLpro es un homodímero de 303 aminoácidos que está formada por tres dominios: dominio I (aminoácidos 8-101), dominio II (102-184) y dominio III (201-303); además cada monómero contiene dos regiones catalíticas N-terminal y C-terminal [11,12]. Esta proteasa hidroliza las uniones glicina-serina dentro de la secuencia de reconocimiento leucina-glicina-serina-alanina-glicina de la proteína pp1ab [1,10-12]. La integridad y funcionalidad de estas proteasas, altamente conservadas, es imprescindible y esencial en el proceso replicativo de estos virus [11-14]. La proteasa principal 3CLpro se ha constituido como una de las posibles dianas terapéuticas para el desarrollo de fármacos antivirales frente al SARS-CoV-2 debido a su secuencia y estructura altamente conservada entre todos los coronavirus [14-16]. Sin embargo, los primeros estudios realizados utilizando los inhibidores de la proteasa de forma individual frente al VIH lopinavir/ritonavir no han mostrado apenas eficacia en los adultos frente al SARS-CoV-2 [16,17]. Del mismo modo, el compuesto AG7088 que es un potente inhibidor de las proteasas 3CLpro de los rinovirus y picornavirus tampoco ha mostrado eficacia frente a las proteasas del SARS-CoV-2 [18-22]. Una de las ventajas de estos antivirales es que no se han descrito pro- teasas humanas análogas a la 3CLpro, de modo que sus posibles inhibidores no afectarían a las células ni presentarían efectos adversos [19-23]. Además, estos fármacos serían eficaces tanto en las actuales como en las futuras variantes genéticas del SARS-CoV-2, dado que su diana molecular no está relacionada con la proteína S de este virus (proteína hipervariable) [1,2].

EL ANTIVIRAL NIRMATRELVIR

Durante la pandemia causada por el SARS-CoV-1 entre los años 2002 y 2003 Hoffman et al. [23] identificaron una pequeña molécula (derivado hidroximetilcetona o PF-00835231) con intensa actividad inhibidora de la proteasa 3CLpro. Dado que las secuencias de las proteasas 3CLpro del SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2 presentan una identidad del 96% y del 100% en el sitio activo [10,15,24], se iniciaron los estudios sobre la utilidad de este compuesto para tratar a los pacientes con la COVID-19 [17]. Boras et al. [17] describieron el profármaco fosfatado de este compuesto (designado PF-07304814) que ha mostrado mayor absorción y biodisponibilidad (Figura 2). Así mismo estudiaron la eficacia de este fármaco y observaron una intensa actividad antiviral frente al SARS-CoV-2 tanto en cultivos celu-lares como en ratones a una concentración efectiva de 0.5 µM. Este dato permite predecir que se alcanzaría esta concentración terapéutica en el ser humano con una dosis de 500 mg en infusión continua durante 24 horas. Así mismo han observado, en cultivos celulares, el efecto sinérgico entre el compuesto PF-00835231 y remdesivir, un análogo de la adenosina que interrumpe la replicación viral [19]. De este modo se podría utilizar esta combinación sinérgica en los pacientes graves o con elevadas cargas virales [17].
Figura 2

Activación por parte de las fosfatasas alcalinas celulares del pro-fármaco PF-07304814 a su forma activa PF-07321332 (nirmatrelvir).

Activación por parte de las fosfatasas alcalinas celulares del pro-fármaco PF-07304814 a su forma activa PF-07321332 (nirmatrelvir). Hammond et al. [25] ha presentado recientemente los datos preliminares de un estudio con el fármaco antiviral nirmatrelvir, que es un potente inhibidor de la proteasa 3CLpro del SARS-CoV-2. Este fármaco es una modificación química del original descrito por Hoffman et al. [23], que se administra a una dosis experimental de 300 mg por vía oral cada 12 horas durante un período de 3 o 5 días. En el estudio aleatorizado, doble ciego, en Fase 2/3 EPIC-HR (Evaluation of Protease Inhibition for COVID-19 in High Risk Patients) realizado en 1.219 pacientes adultos no hospitalizados con infección demostrada por SARS-CoV-2 y elevado riesgo de progresión a enfermedad grave, por patologías previas, se demostró una reducción del 89% en el riesgo de hospitalización o fallecimiento por cualquier causa frente a placebo en pacientes tratados en los 3 primeros días desde el inicio de los síntomas. De este modo sólo el 0,8% de los pacientes que recibieron nirmatrelvir fueron hospitalizados durante los 28 días siguientes al inicio del tratamiento (sin ningún fallecimiento) (3/389 pacientes), mientras que en el grupo del placebo se hospitalizaron el 7% (con siete fallecimientos entre ellos), siendo estos datos estadísticamente significativos (27/385 pacientes) (p<0.0001). Datos similares se observaron en los pacientes tratados en los primeros 5 días desde inicio de los síntomas. Sólo se hospitalizaron el 1% de los tratados con nirmatrelvir durante los 28 días siguientes, mientras que si lo hicieron el 6,7% del grupo placebo (p<0,0001). Globalmente a los 28 días del inicio de los síntomas no se comunicó ningún fallecimiento entre los que recibieron el inhibidor 3CLpro nirmatrelvir, pero si ocurrió en el 1.6% (10 casos) de los que recibieron placebo. Los efectos adversos detectados fueron muy parecidos entre los dos grupos (19-21%), la mayoría de ellos considerados como moderados. Los efectos adversos graves se produjeron en el 1,7% de los tratados con nirmatrelvir frente al 6.6% del grupo placebo y el cese de tratamiento se detectó en el 2.1% de los tratados con el antiviral (4,1% grupo placebo) [25]. Por su parte Owen et al. [26] han observado en ratones adaptados al SARS-CoV-2 que el tratamiento a la dosis de 300 mg/kg/2 veces al día les protegía de la infección intranasal por este virus. Además, comprobaron una disminución significativa de la carga viral en el tracto respiratorio y parénquima pulmonar, confirmando su potente efecto antiviral. En un ensayo clínico de seguridad, tolerabilidad y farmacocinética se observó en adultos sanos (ClinicalTrial.gov. NCT04756531) que dosis bajas de ritonavir (100 mg) enlentecían el metabolismo y la desactivación de nirmatrelvir por la citocromo-oxidasa hepática, de modo que permanecía activo durante períodos mas prolongados y en concentraciones mas elevadas [25,26]. Además, nirmatrelvir se ha mostrado altamente eficaz en el bloqueo de la transcripción de las principales variantes del SARS-CoV-2 descritas hasta la actualidad [22]. La FDA aprobó la combinación nirmatrelvir más ritonavir (PaxlovidTM) el 6 de noviembre de 2021 para su comercialización y administración en humanos. La dosis recomendada sería de 300 mg del nuevo antiviral (dos pastillas de 150 mg) junto a una pastilla de ritonavir (100 mg) dos veces al día durante 5 días [27]. La administración oral de este antiviral y sus escasos efectos adversos podrían permitir su utilización generalizada al inicio de los primeros síntomas de infección por SARS-CoV-2. Como la mayoría de otros antivirales frente a los virus respiratorios, el tratamiento debería iniciarse en las primeras 24-48 horas tras la aparición de los síntomas, coincidiendo con la fase replicativa mas intensa del virus. Su utilización podría evitar las formas graves de la COVID-19 y disminuir los ingresos hospitalarios, tanto en pacientes vacunados como en los no vacunados e incluso en las reinfecciones por variantes distintas a la primoinfección, como la ómicron, actualmente en circulación masiva [28,29].
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1.  Exchange of the coronavirus replicase polyprotein cleavage sites alters protease specificity and processing.

Authors:  Mark J Gadlage; Mark R Denison
Journal:  J Virol       Date:  2010-04-28       Impact factor: 5.103

Review 2.  Coronaviruses - drug discovery and therapeutic options.

Authors:  Alimuddin Zumla; Jasper F W Chan; Esam I Azhar; David S C Hui; Kwok-Yung Yuen
Journal:  Nat Rev Drug Discov       Date:  2016-02-12       Impact factor: 84.694

3.  Structure-based design of antiviral drug candidates targeting the SARS-CoV-2 main protease.

Authors:  Wenhao Dai; Bing Zhang; Xia-Ming Jiang; Haixia Su; Jian Li; Yao Zhao; Xiong Xie; Zhenming Jin; Jingjing Peng; Fengjiang Liu; Chunpu Li; You Li; Fang Bai; Haofeng Wang; Xi Cheng; Xiaobo Cen; Shulei Hu; Xiuna Yang; Jiang Wang; Xiang Liu; Gengfu Xiao; Hualiang Jiang; Zihe Rao; Lei-Ke Zhang; Yechun Xu; Haitao Yang; Hong Liu
Journal:  Science       Date:  2020-04-22       Impact factor: 47.728

4.  Learning from the Past: Possible Urgent Prevention and Treatment Options for Severe Acute Respiratory Infections Caused by 2019-nCoV.

Authors:  Jared S Morse; Tyler Lalonde; Shiqing Xu; Wenshe Ray Liu
Journal:  Chembiochem       Date:  2020-02-25       Impact factor: 3.164

Review 5.  Structural Basis of Potential Inhibitors Targeting SARS-CoV-2 Main Protease.

Authors:  Hylemariam Mihiretie Mengist; Tebelay Dilnessa; Tengchuan Jin
Journal:  Front Chem       Date:  2021-03-12       Impact factor: 5.221

Review 6.  [Plitidepsin, an inhibitor of the cell elongation factor eEF1a, and molnupiravir an analogue of the ribonucleoside cytidine, two new chemical compounds with intense activity against SARS-CoV-2].

Authors:  J Reina
Journal:  Rev Esp Quimioter       Date:  2021-04-27       Impact factor: 1.553

Review 7.  A Patent Review on SARS Coronavirus Main Protease (3CLpro ) Inhibitors.

Authors:  C S Brian Chia; Weijun Xu; Pearly Shuyi Ng
Journal:  ChemMedChem       Date:  2021-10-28       Impact factor: 3.540

8.  Processing of the SARS-CoV pp1a/ab nsp7-10 region.

Authors:  Boris Krichel; Sven Falke; Rolf Hilgenfeld; Lars Redecke; Charlotte Uetrecht
Journal:  Biochem J       Date:  2020-03-13       Impact factor: 3.857

Review 9.  Viral Proteases as Targets for Coronavirus Disease 2019 Drug Development.

Authors:  Wei Zhu; Zeenat Shyr; Donald C Lo; Wei Zheng
Journal:  J Pharmacol Exp Ther       Date:  2021-05-10       Impact factor: 4.030

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Review 1.  4'-Fluorouridine Is a Broad-Spectrum Orally Available First-Line Antiviral That May Improve Pandemic Preparedness.

Authors:  Carolin M Lieber; Richard K Plemper
Journal:  DNA Cell Biol       Date:  2022-07-05       Impact factor: 3.550

Review 2.  Paxlovid: Mechanism of Action, Synthesis, and In Silico Study.

Authors:  Mahrokh Marzi; Mohammad Kazem Vakil; Maryam Bahmanyar; Elham Zarenezhad
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5.  Network Pharmacology and Bioinformatics Analysis Identifies Potential Therapeutic Targets of Paxlovid Against LUAD/COVID-19.

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