Objetivo. Describir el comportamiento de la epidemia de SARS-CoV-2 entre los trabajadores afiliados al Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS). Material y métodos. Se analizaron las incapacidades temporales para el trabajo por enfermedades respiratorias (ITT-ER), las hospitalizaciones y defunciones asociadas durante el periodo del 1 marzo al 31 diciembre 2020. Se estimó la tasa de ataque (TA) por SARS-CoV-2, así como los riesgos relativos (RR) de ITT-ER, hos-pitalización y defunción. Resultados. De los trabajadores afiliados al IMSS, 8.8% (n=1 730 334) recibió al menos una ITT-ER. La TA fue mayor en mujeres y en ambos sexos fue menor en el grupo de >60 años. Los RR de hospitalización y defunción fueron mayores en hombres y aumentaron con la edad. Comparado con las ITT-ER de 2015-2019, Durango, Tamaulipas y Nuevo León tuvieron un RR mayor de ITT-ER que el resto del país. Conclusiones. La epidemia de SARS-CoV-2 tuvo repercusiones importantes en los trabajadores afiliados al IMSS; se observó un exceso de ITT-ER de 4.6 veces respecto a la frecuencia esperada y cerca de un millón de casos de SARS-CoV-2. Los datos sugieren que el sistema de ITT-ER puede ser utilizado como elemento adicional para la vigilancia epidemiológica de enfermedades emergentes.