| Literature DB >> 34807276 |
Korinna Jöhrens1, Josephine Fischer2, Markus Möbs3, Klaus Junker4, Jutta Kirfel5, Sven Perner5, Silke Laßmann6, Martin Werner6, Vanessa Borgmann7, Hendrik Bläker8, Michael Hummel9.
Abstract
Round robin testing is an important instrument for quality assurance. Increasingly, this also applies to the results of molecular diagnostics in pathology, which directly influence therapy decisions in precision oncology. In metastatic colorectal carcinoma (mCRC), the focus has been on detecting KRAS and NRAS mutations, whose absence allows therapy with EGFR blocking antibodies. Recently, BRAF has been added as another predictive marker, since mCRC patients with BRAF V600E mutation benefit significantly from treatment with encorafenib (a BRAF inhibitor) in combination with cetuximab (anti-EGFR antibody) after systemic therapy. Due to the approval of this treatment in 2020, it is a pre-requisite that BRAF V600E mutation detection in diagnostic pathologies is reliably performed. Therefore, this round robin test with BRAF V600E testing either by immunohistochemistry or molecular methods was performed. The round robin test results demonstrate that molecular BRAF V600E detection is currently clearly superior to immunohistochemical detection.Entities:
Keywords: BRAF mutation; Cororectal cancer; Molecular pathology; Precision oncology; Round robin test
Mesh:
Substances:
Year: 2021 PMID: 34807276 PMCID: PMC8888471 DOI: 10.1007/s00292-021-01022-8
Source DB: PubMed Journal: Pathologe ISSN: 0172-8113 Impact factor: 1.011
| Fall-Nr. | Mutationsstatus | Altera des Blocks (in Monaten) | Tumorzellgehalt (in %) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| MolPath | IHC | Erster Schnitt | Letzter Schnitt | ||
| 1 | 2 | V600E | 133 | 80 | 70 |
| 2 | 5 | V600E | 133 | 60 | 70 |
| 3 | 4 | WT | 26 | 70 | 50 |
| 4 | 7 | V600E | 31 | 90 | 80 |
| 5 | 6 | WT | 24 | 70 | 90 |
| 6 | 1 | V600E | 26 | 70 | 90 |
| 7 | 8 | V600E | 10 | 80 | 80 |
| 8 | 10 | WT | 24 | 80 | 75 |
| 9 | 3 | V600E | 20 | 70 | 80 |
| 10 | 9 | V600E | 20 | 80 | 70 |
IHC Immunhistochemie
aDas Alter des Blocks wurde berechnet als die Spanne zwischen der Erstbefundung des Blocks bis zum Beginn des Ringversuchs am 02.06.2020
| Fall | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Positiv | 1 | 0 | 0 | |||||||
| Negativ | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |||
| Nicht auswertbar | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| Anzahl der Teilnehmer | Richtig positiv | Richtig negativ | Falsch positiv | Falsch negativ | Nicht auswertbar | Punkte | Erfolg |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 40 | 7 | 3 | 0 | 0 | 0 | 20 | Ja |
| 1 | 7 | 2 | 0 | 0 | 1 | 19 | Ja |
| 1 | 7 | 2 | 1 | 0 | 0 | 18 | Ja |
| Kategorie | Hersteller | Verwendetes DNA-Extraktionskit | Teilnehmer | Mit Erfolg (%) |
|---|---|---|---|---|
| Vollautomatisiert | Biocartis, Mecheln, Belgien | Idylla™ BRAF Mutation Assay | 11 | 11 (100) |
| Labortechnische Einzelprozessierung | Analytik Jena GmbH, Jena, Deutschland | innuPREP FFPE DNA Kit-IPC16 | 1 | 1 (100) |
| Promega GmbH, Waldorf, Deutschland | Maxwell 16 FFPE (Plus) LEV DNA Purification Kit | 5 | 5 (100) | |
| Promega | Maxwell 16 LEV Blood DNA Kit | 1 | 1 (100) | |
| Promega | Maxwell 16 LEV RNA FFPE Purification Kit | 2 | 2 (100) | |
| Promega | Maxwell RSC DNA FFPE Kit | 4 | 4 (100) | |
| Promega GmbH | ReliaPrep™ FFPE gDNA Miniprep System | 1 | 1 (100) | |
| Qiagen GmbH, Hilden, Deutschland | QIAamp DNA FFPE Tissue Kit | 4 | 4 (100) | |
| Qiagen | QIAamp DNA Micro Kit | 3 | 3 (100) | |
| Qiagen | QIAsymphony DSP DNA Mini Kit | 1 | 1 (100) | |
| Qiagen | RNeasy FFPE Kit | 2 | 2 (100) | |
| STRATIFYER Molecular Pathology GmbH, Köln, Deutschland | XTRAKT FFPE Kit | 1 | 1 (100) | |
| Zymo Research, Irvine, USA | Quick-DNA™ FFPE Kit | 1 | 1 (100) | |
| – | Andere | 5 | 5 (100) |

| Kategorie | Methode | Hersteller | Plattform | Teilnehmer | Mit Erfolg (%) |
|---|---|---|---|---|---|
| Vollautomatisiert | – | Biocartis, Mecheln, Belgien | Idylla | 11 | 11 (100) |
| Labortechnische Einzelprozessierung | Illumina, Berlin, Deutschland | Miniseq | 1 | 1 (100) | |
| Illumina | MiSeq | 2 | 2 (100) | ||
| Illumina | NextSeq | 1 | 1 (100) | ||
| Thermo Fisher Scientific, Dreiach, Deutschland | Ion GeneStudio S5 | 3 | 3 (100) | ||
| Thermo Fisher | Ion Personal Genome Machine™ (PGM™) | 1 | 1 (100) | ||
| Qiagen, Venlo, Niederlande | PyroMark | 8 | 8 (100) | ||
| Agilent Technologies, Santa Clara, USA | Stratagene Mx3005P | 1 | 1 (100) | ||
| Roche Diagnostics GmbH, Grenzach, Deutschland | LightCycler® 480 | 1 | 1 (100) | ||
| Thermo Fisher Scientfic, Dreiach, Deutschland | 7500 Real-Time PCR System | 1 | 1 (100) | ||
| Thermo Fisher | Arktik Thermal Cycler | 1 | 1 (100) | ||
| Thermo Fisher | Quant Studio | 2 | 2 (100) | ||
| Zytomed Systems GmbH, Berlin, Deutschland | SLAN-96S | 1 | 1 (100) | ||
| – | Andere | 1 | 1 (100) | ||
| Thermo Fisher | Quant Studio | 1 | 1 (100) | ||
| Applied Biosystems, Waltham, USA | Genetic Analyzer 3500 | 1 | 1 (100) | ||
| – | Andere | 3 | 3 (100) | ||
| Roche | LightCycler® 480 | 1 | 1 (100) | ||
| – | Thermocycler und Wasserbad | 1 | 1 (100) |
| Kategorie | Methode | Hersteller | Plattform | Teilnehmer |
|---|---|---|---|---|
| Vollautomatisiert | – | Biocartis, Mecheln, Belgien | Idylla™ BRAF Mutation Assay | 11 |
| Labortechnische Einzelprozessierung | Agilent Technologies, Santa Clara, USA | Tumor Hotspot Panel | 1 | |
| Qiagen GmbH, Hilden, Deutschland | QIAseq Human Actionable Solid Tumor Panel | 1 | ||
| Qiagen | QIAseq Targeted DNA Custom Panel | 1 | ||
| Thermo Fisher Scientific, Dreiach, Deutschland | Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 | 1 | ||
| Thermo Fisher | Ion AmpliSeq™ Colon and Lung Cancer v2 | 1 | ||
| Thermo Fisher | Oncomine Focus Assay | 2 | ||
| – | Amplikon BRAF Exon 15 | 1 | ||
| Qiagen | Therascreen BRAF Pyro Kit | 4 | ||
| – | Laboratory Developed Tests (LDT) | 4 | ||
| Amoy Diagnostics, Xiamen, China | BRAF V600 Mutations Detection Kit | 1 | ||
| EntroGen, Woodland Hills, USA | BRAF Mutation Analysis Kit II for Real-Time PCR | 1 | ||
| Roche Diagnostics GmbH, Grenzach, Deutschland | BRAF/NRAS Mutation Test (LSR) | 1 | ||
| Thermo Fisher | BRAF TaqMan® Mutation Detection Assays | 1 | ||
| ViennaLab Diagnostics GmbH, Wien, Österreich | BRAF 600/601 StripAssay® | 1 | ||
| – | Laboratory Developed Tests (LDT) | 2 | ||
| – | Andere | 1 | ||
| SCIEX, Framingham, USA | DTCS QUICK START KIT | 1 | ||
| – | Laboratory Developed Tests (LDT) | 2 | ||
| – | Andere | 2 | ||
| – | Laboratory Developed Tests (LDT) | 1 | ||
| Medipro (ViennaLab Diagnostics GmbH) | BRAF KIT | 1 |
| Fall | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Positiv | 2 | 0 | 0 | |||||||
| Negativ | 4 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | ||||
| Nicht auswertbar | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| Anzahl der Teilnehmer | Richtig positiv | Richtig negativ | Falsch positiv | Falsch negativ | Nicht auswertbar | Punkte | Erfolg |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4 | 6 | 3 | 0 | 0 | 1 | 20 | Ja |
| 1 | 5 | 3 | 0 | 1 | 1 | 18 | Ja |
| 1 | 6 | 2 | 1 | 0 | 1 | 18 | Ja |
| 1 | 5 | 2 | 1 | 1 | 1 | 16 | Nein |
| 1 | 4 | 3 | 0 | 2 | 1 | 16 | Nein |
| 1 | 4 | 3 | 0 | 1 | 2 | 18 | Nein |
| Teilnehmer | Erfolg | Antikörper | Inkubationszeit in min | Verdünnung |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Ohne Erfolg | VE1 (Abcam, Cambridge, UK) | 92 | 1:100 (10 µg/ml) |
| 2 | Ohne Erfolg | VE1 (Abcam) | 60 | 1:100 (10 µg/ml) |
| 3 | Ohne Erfolg | VE1 (Abcam) | 8 | 1:100 (10 µg/ml) |
| 4 | Mit Erfolg | VE1 (Abcam) | 15 | 1:50 (20 µg/ml) |
| 5 | Mit Erfolg | VE1 (Abcam) | 20 | 1:50 (20 µg/ml) |
| 6 | Mit Erfolg | VE1 (Roche Diagnostics GmbH, Grenzach, Deutschland) | 32 | Ready-to-use (12 µg/ml) |
| 7 | Mit Erfolg | VE1 (Roche) | 32 | Ready-to-use (12 µg/ml) |
| 8 | Mit Erfolg | VE1 (Roche) | 16 | Ready-to-use (12 µg/ml) |
| 9 | Mit Erfolg | Andere | 15 | 1:100 (10 µg/ml) |


