| Literature DB >> 34629639 |
María Isolina Santiago Pérez1, Esther López-Vizcaíno2, Alberto Ruano-Ravina3,4,5, Mónica Pérez-Ríos3,4,5.
Abstract
INTRODUCTION: The SARS-CoV-2 pandemic is the most important health challenge observed in 100 years, and since its emergence has generated the highest excess of non-war-related deaths in the western world. Since this disease is highly contagious and 33% of cases are asymptomatic, it is crucial to develop methods to predict its course. We developed a predictive model for Covid-19 infection in Spanish provinces.Entities:
Keywords: Alert levels; Covid-19; Incidence rates; Modelization; Spain
Year: 2021 PMID: 34629639 PMCID: PMC7826127 DOI: 10.1016/j.arbres.2020.12.036
Source DB: PubMed Journal: Arch Bronconeumol ISSN: 0300-2896 Impact factor: 4.872
Fechas de inicio y fin del período de estudio de 92 días, número acumulado de casos de COVID-19 en ese período e incidencia acumulada por 100.000 habitantes en las 52 provincias. Tasas de incidencia a 7 días el 15 de marzo de 2020, sin corregir y corregidas
| Período de estudio | Valores acumulados en todo el período | Tasa de incidencia a 7 días × 105 a día 15-03-2020 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Provincia | Inicio | Fin | Población | Casos | Casos × 105 | Sin corregir | Corregida | |
| 1 | Araba | 29/02/2020 | 30/05/2020 | 329.857 | 3.394 | 1.028,9 | 93,2 | 619,1 |
| 2 | Albacete | 01/03/2020 | 31/05/2020 | 389.830 | 4.624 | 1.186,2 | 31,9 | 429,5 |
| 3 | Alicante | 05/03/2020 | 04/06/2020 | 1.885.214 | 3.885 | 206,1 | 10,3 | 120,2 |
| 4 | Almería | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 715.406 | 525 | 73,4 | 2,9 | 53,8 |
| 5 | Ávila | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 158.930 | 1.746 | 1.098,6 | 6,4 | 61,0 |
| 6 | Badajoz | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 670.782 | 907 | 135,2 | 3,6 | 39,0 |
| 7 | Balears, Illes | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 1.210.750 | 2.100 | 173,4 | 5,3 | 78,8 |
| 8 | Barcelona | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 5.635.043 | 44.647 | 792,3 | 34,5 | 282,6 |
| 9 | Burgos | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 355.777 | 2.141 | 601,8 | 33,3 | 318,8 |
| 10 | Cáceres | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 390.986 | 2.052 | 524,8 | 16,6 | 181,2 |
| 11 | Cádiz | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 1.254.628 | 1.259 | 100,3 | 3,7 | 68,8 |
| 12 | Castellón | 05/03/2020 | 04/06/2020 | 574.900 | 1.550 | 269,6 | 5,5 | 64,0 |
| 13 | Ciudad Real | 01/03/2020 | 31/05/2020 | 494.128 | 7.872 | 1.593,1 | 24,7 | 331,4 |
| 14 | Córdoba | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 784.256 | 1.332 | 169,8 | 9,6 | 178,8 |
| 15 | Coruña, A | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 1.123.480 | 4.048 | 360,3 | 9,7 | 59,8 |
| 16 | Cuenca | 01/03/2020 | 31/05/2020 | 199.828 | 1.801 | 901,3 | 22,5 | 301,8 |
| 17 | Girona | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 767.119 | 4.533 | 590,9 | 17,4 | 142,5 |
| 18 | Granada | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 925.059 | 2.422 | 261,8 | 8,8 | 164,1 |
| 19 | Guadalajara | 01/03/2020 | 31/05/2020 | 262.403 | 1.729 | 658,9 | 46,6 | 626,1 |
| 20 | Gipuzkoa | 29/02/2020 | 30/05/2020 | 716.530 | 2.430 | 339,1 | 7,7 | 51,2 |
| 21 | Huelva | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 528.059 | 403 | 76,3 | 1,5 | 28,4 |
| 22 | Huesca | 04/03/2020 | 03/06/2020 | 220.657 | 1.007 | 456,4 | 6,7 | 82,0 |
| 23 | Jaén | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 628.841 | 1.425 | 226,6 | 7,1 | 132,9 |
| 24 | León | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 459.141 | 2.805 | 610,9 | 10,3 | 98,7 |
| 25 | Lleida | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 435.607 | 2.594 | 595,5 | 15,1 | 123,3 |
| 26 | Rioja, La | 27/02/2020 | 28/05/2020 | 315.926 | 3.888 | 1.230,7 | 65,7 | 170,9 |
| 27 | Lugo | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 328.153 | 789 | 240,4 | 5,8 | 35,7 |
| 28 | Madrid | 24/02/2020 | 25/05/2020 | 6.747.425 | 69.762 | 1.033,9 | 79,5 | 933,0 |
| 29 | Málaga | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 1.683.271 | 2.644 | 157,1 | 14,6 | 271,7 |
| 30 | Murcia | 09/03/2020 | 08/06/2020 | 1.504.607 | 1.591 | 105,7 | 4,8 | 67,1 |
| 31 | Navarra | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 656.487 | 5.391 | 821,2 | 41,0 | 307,3 |
| 32 | Ourense | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 306.802 | 1.743 | 568,1 | 8,2 | 50,2 |
| 33 | Asturias | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 1.018.775 | 2.392 | 234,8 | 14,9 | 116,4 |
| 34 | Palencia | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 159.846 | 1.062 | 664,4 | 3,1 | 29,9 |
| 35 | Palmas, Las | 06/03/2020 | 05/06/2020 | 1.151.352 | 743 | 64,5 | 3,4 | 59,7 |
| 36 | Pontevedra | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 943.809 | 2.662 | 282,0 | 6,9 | 42,4 |
| 37 | Salamanca | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 331.048 | 3.045 | 919,8 | 9,4 | 90,3 |
| 38 | Sta. Cruz de Tenerife | 06/03/2020 | 05/06/2020 | 1.085.958 | 1.582 | 145,7 | 7,4 | 130,9 |
| 39 | Cantabria | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 582.357 | 2.296 | 394,3 | 7,9 | 65,5 |
| 40 | Segovia | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 154.228 | 2.505 | 1.624,2 | 17,6 | 168,7 |
| 41 | Sevilla | 08/03/2020 | 07/06/2020 | 1.957.197 | 2.430 | 124,2 | 4,5 | 83,1 |
| 42 | Soria | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 89.912 | 1.389 | 1.544,8 | 5,6 | 53,9 |
| 43 | Tarragona | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 814.300 | 2.239 | 275,0 | 4,8 | 39,1 |
| 44 | Teruel | 04/03/2020 | 03/06/2020 | 133.291 | 629 | 471,9 | 11,2 | 136,1 |
| 45 | Toledo | 01/03/2020 | 31/05/2020 | 699.195 | 4.885 | 698,7 | 18,3 | 246,5 |
| 46 | Valencia | 05/03/2020 | 04/06/2020 | 2.568.536 | 5.976 | 232,7 | 10,6 | 124,3 |
| 47 | Valladolid | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 520.716 | 4.349 | 835,2 | 7,7 | 73,6 |
| 48 | Bizkaia | 29/02/2020 | 30/05/2020 | 1.142.923 | 8.418 | 736,5 | 11,1 | 74,0 |
| 49 | Zamora | 02/03/2020 | 01/06/2020 | 171.630 | 657 | 382,8 | 4,7 | 44,9 |
| 50 | Zaragoza | 04/03/2020 | 03/06/2020 | 976.498 | 4.628 | 473,9 | 13,6 | 165,2 |
| 51 | Ceuta | 11/03/2020 | 10/06/2020 | 84.032 | 168 | 199,9 | 1,2 | 9,7 |
| 52 | Melilla | 07/03/2020 | 06/06/2020 | 84.496 | 122 | 144,4 | 9,2 | 123,9 |
Figura 1Incidencia acumulada de casos de COVID-19 por 100.000 habitantes en las 52 provincias españolas en un período de 92 días, que varía por provincia entre el 24 de febrero y el 8 de junio.
Figura 2Componentes principales de las 52 curvas de incidencia acumulada de casos de COVID-19 por 100.000 habitantes en un período de 92 días, que varía por provincia entre el 24 de febrero y el 8 de junio.
Figura 3Coordenadas de las 52 provincias en las 2 componentes principales de las curvas de incidencia acumulada y clasificación en 3 grupos a partir de las coordenadas.
Figura 4Distribución geográfica de los grupos de diferente evolución de la pandemia.
Prevalencia y número estimado de casos de infección por COVID-19 en España en la primera ronda del estudio ENE-Covid19, número de casos diagnosticados hasta el 11 de mayo, tasa de detección estimada (%) y su inverso (corrección)
| Estudio ENE-Covid19 ronda 1 | Hasta el 11-05-2020 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Comunidad autónoma | % infecciones | N.o infecciones | N.o de casos | % detección | Corrección | |
| 1 | Andalucía | 2,7 | 228.871 | 12.293 | 5,4 | 18,6 |
| 2 | Aragón | 4,9 | 65.192 | 5.359 | 8,2 | 12,2 |
| 3 | Asturias | 1,8 | 18.338 | 2.351 | 12,8 | 7,8 |
| 4 | Islas Baleares | 2,4 | 29.058 | 1.953 | 6,7 | 14,9 |
| 5 | Canarias | 1,8 | 40.272 | 2.268 | 5,6 | 17,8 |
| 6 | Cantabria | 3,2 | 18.635 | 2.246 | 12,1 | 8,3 |
| 7 | Castilla y León | 7,2 | 172.888 | 18.048 | 10,4 | 9,6 |
| 8 | Castilla-La Mancha | 10,8 | 220.901 | 16.431 | 7,4 | 13,4 |
| 9 | Cataluña | 5,9 | 451.472 | 55.144 | 12,2 | 8,2 |
| 10 | C. Valenciana | 2,5 | 125.716 | 10.740 | 8,5 | 11,7 |
| 11 | Extremadura | 3,0 | 31.853 | 2.919 | 9,2 | 10,9 |
| 12 | Galicia | 2,1 | 56.747 | 9.219 | 16,2 | 6,2 |
| 13 | Madrid | 11,3 | 762.459 | 64.972 | 8,5 | 11,7 |
| 14 | Murcia | 1,4 | 21.064 | 1.517 | 7,2 | 13,9 |
| 15 | Navarra | 5,8 | 38.076 | 5.081 | 13,3 | 7,5 |
| 16 | País Vasco | 4,0 | 87.572 | 13.176 | 15,0 | 6,6 |
| 17 | La Rioja | 3,3 | 10.426 | 4.008 | 38,4 | 2,6 |
| 18 | Ceuta | 1,1 | 924 | 114 | 12,3 | 8,1 |
| 19 | Melilla | 1,9 | 1.605 | 119 | 7,4 | 13,5 |
| ESPAÑA | 5,0 | 2.366.499 | 227.958 | 9,6 | 10,4 | |
Área bajo la curva ROC de la tasa de incidencia a 7 días el 15 de marzo de 2020, punto de corte óptimo de la curva y medidas de precisión asociadas al punto de corte para 2 niveles de alerta
| Nivel 1: evolución intermedia | Nivel 2: peor evolución | |||
|---|---|---|---|---|
| Valor | IC95% | Valor | IC95% | |
| Área bajo la curva ROC | 0,770 | 0,643-0,898 | 0,757 | 0,569-0,945 |
| Punto de corte óptimo | ||||
| Sensibilidad | 59,3% | 38,8-77,6 | 70,0% | 34,8-93,3 |
| Especificidad | 88,0% | 68,8-97,5 | 81,0% | 65,9-91,4 |
| Valor predictivo positivo | 84,2% | 60,4-96,6 | 46,7% | 21,3-73,4 |
| Valor predictivo negativo | 66,7% | 48,2-82 | 91,9% | 78,1-98,3 |
En negrita, puntos de corte.