| Literature DB >> 34580287 |
Fiona Freyberger1,2, Tomislav Kokotović1,2,3, Goran Krnjak4, Sanda Huljev Frković5, Vanja Nagy6,7,8.
Abstract
Here, we report a novel case of a male patient with a hemizygous missense variant in STAG2 (p.Tyr159His) resulting in Mullegama-Klein-Martinez syndrome (MKMS), a rare X-linked cohesinopathy. He shares distinct clinical features with a previously reported male patient carrying the STAG2 variant p.Tyr159Cys, suggesting that this phenotype is determined by the position of the mutation. Additionally, our patient exhibits symptoms not previously associated with MKMS, expanding the known clinical phenotype of this rare disease.Entities:
Year: 2021 PMID: 34580287 PMCID: PMC8476567 DOI: 10.1038/s41439-021-00169-3
Source DB: PubMed Journal: Hum Genome Var ISSN: 2054-345X
Clinical features of the MKMS patients.
| Clinical features | Patient | P1 | P2 | P3 | P4 | P5 | P6 | P7 | P8 | P9 | P10 | P11 | P12 | P13 | P14 | P15 | P16 | P17 | P18 | P19 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sex | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | M | M | M | M | ||
| cDNA change | c.418C>T | c.1605T>A | c.1811G>A | c.1658_1660 delinsT | c.205C>T | c.3097C>T | c.2229G>A | c.1840C>T | c.205C>T | c.436C>T | c.775C>T | c.3034C>T | c.2898_2899del | c.2533+1G>A | c.1639delG | c.3027A>T | c.980G>A | c.476A>G | c.475T>C | ||
| Growth abnormalities | IUGR | − | + | − | − | − | NR | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | + | |
| Failure to thrive | NR | + | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | + | + | ||
| Short stature | NR | + | + | + | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | + | ||
| Dysmorphic features and malformations | Neurocranium | Pathological brain MRI | NR | NR | NR | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | NR | + | + |
| Microcephaly | − | + | + | + | + | NR | + | + | + | + | − | + | + | + | NR | + | NR | − | − | ||
| Brachicephaly | − | + | NR | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | ||
| Eyes | Long eyelashes | NR | + | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | |
| Strabismus | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Nose | Anteverted nares | NR | NR | + | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | |
| Broad bridge | − | − | + | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | ||
| Bulbous tip | − | NR | + | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | ||
| Ears | Low set | NR | NR | − | + | + | NR | NR | NR | − | + | − | + | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | |
| Dysmorphic | + | + | + | + | + | NR | NR | NR | − | NR | − | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | + | ||
| Lips and mouth | Long philltrum | NR | + | + | − | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | |
| Thin upper lip | + | + | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | − | ||
| Downturned mouth | NR | NR | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Cleft palate | − | − | NR | − | + | + | + | NR | + | NR | NR | + | NR | NR | NR | − | + | + | − | ||
| High arched palate | − | − | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | ||
| Micrognathia | NR | + | + | + | + | NR | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | + | ||
| Skin and adnexa | Marmorization | NR | + | NR | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | |
| Low hairline | NR | + | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | NR | NR | + | ||
| Hirsutism | NR | + | NR | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Hipoplastic nails | + | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Hands and feet | Fifth finger clindactily | NR | + | NR | − | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | − | NR | − | |
| Single palmar crease | − | + | NR | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | ||
| Second–third toe syndactily | − | + | NR | − | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | NR | − | − | ||
| Other skeletal | Scoliosis | + | NR | NR | + | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | + | +* | ||
| Rib fusion | + | NR | + | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Vertebral abnormalities | + | NR | + | + | NR | NR | + | NR | − | + | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Other systems | Renal tract abnormalities | − | NR | NR | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | − | |
| Pulmonary hypoplasia | NR | NR | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Congenital diaphragmatic hernia | + | NR | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | ||
| GERD | + | + | + | − | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Congenital heart failure | + | NR | − | NR | + | + | − | NR | + | + | + | NR | − | + | NR | − | − | + | −* | ||
| Abnormal echocardiogram | + | NR | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | − | − | ||
| Neuro functional | NDD | + | + | + | + | + | NR | + | + | + | NR | + | NR | + | NR | + | + | + | + | + | |
| ID | NR | + | + | + | + | NR | + | NR | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | + | + | + | ||
| Seizures | + | NR | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | NR | NR | − | + | ||
| Hypotonia | NR | + | + | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | NR | + | + | ||
| Hearing loss | NR | + | NR | − | + | NR | + | NR | − | − | − | NR | NR | NR | + | − | + | − | − | ||
| Behavioral problems | NR | + | NR | + | − | NR | + | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | NR | + | NR | − | − | ||
Additional clinical features: P1—myoclonisms, hypoplastic left heart, VSD, CA, vertebral clefts; P2—low, posterior hairline; P4—irritability in behavior; P5—ADHD, dysgenesis of the splenium of the corpus callosum, interventricular subarachnoid cyst, subgaleal hematoma, left facial palsy, mild left pelviectasis; P6—pregnancy was terminated at 21 gestational weeks because of multiple fetal abnormalities; P7—white matter hypoplasia, speech delay, amblyopia; P8—cystic pituitary lesion, sacral dimple, CDH; P9—left heart hypoplasia, VSD, CA; P10—cyclopia, absent nose, duodenal atresia; P11—septo-optic dysplasia, left hip dysplasia, bilateral optic nerve hypoplasia, P12—GERD, P14—left heart hypoplasia, DORV; P15—focal seizures with secondary generalization, gelastic seizures (age of onset 6 years; drug resistant), dysmorphic features; P16—high hairline, foot polydactyly; P17—large nose, prominent ears, frontal baldness; P18—minimal PFO, normal on follow-up, single kidney, ectopic posterior pituitary, short pituitary stalk; P19—dolichocephaly, broad hands and feet with soft dorsum and deeply inserted nails, hyperextensible joints, polymicrogyria, hypotrophic presplenial part of corpus callosum, ectopic posterior pituitary, thin pituitary stalk.
P1–P3: Yuan et al.[4]; P4–P5: Mullegama et al.[1]; P6–P8: Aoi et al.[2]; P9–P11: Lan Yu et al.[9]; P12–P14: Kruszka et al.[6]; P15: Epilepsy Genetics Initiative[8]; P16: Mullegama et al.[5]; P17: Soardi et al.[3]; P18: Yuan et al.[4]; P19: this study.
Fig. 1Patient phenotype and EEG.
A Clinical photos of the patient at 11 years of age. B MRI images taken at 7 years of age. The upper left panel shows presplenial corpus callosum hypoplasia and an ectopic neurohypophysis positioned along the caudal part of the infundibulum (indicated by arrow, T1 sequence). The other three images show an extensive frontotemporoparietal area of cortical thickening consistent with polymicrogyria; the left parietal lobe had a deep sulcus impressed into the lateral ventricle (T2 sequence). C Bilateral longitudinal montage, sensitivity 7 µV/mm. Asleep, N2 stage. Continuous beta activity was most pronounced over frontocentral regions. The EEG was taken at 7 years of age.
Fig. 2Mode of inheritance of this variant within the affected family and summary of all other reported variants.
A Left panel—family pedigree, with squares representing males and circles representing females; dots represent carriers of the variant, and the affected patient is shaded in black. Right panel—Sanger sequencing chromatogram of all the analyzed family members, as labeled. B Summary of the reported pathogenic variants and their positions within the STAG2 protein. Our patient’s mutation is marked in red. C Heatmap of the common groups of symptoms described in the literature in patients with STAG2 mutations. Groups of symptoms arranged by frequency from most common to least common.