Literature DB >> 34149139

[Antigen-detecting rapid tests or real-time PCR, what test to use and why?]

Boris Revollo1, Josep M Llibre1.   

Abstract

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Year:  2021        PMID: 34149139      PMCID: PMC8196327          DOI: 10.1016/j.eimc.2021.06.001

Source DB:  PubMed          Journal:  Enferm Infecc Microbiol Clin        ISSN: 0213-005X            Impact factor:   1.731


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Sr. Editor: Hemos leído con interés la carta de Marco et al. en referencia a la baja sensibilidad de los test rápidos antigénicos (TRA) para cribar la infección por SARS-CoV-2. Los autores reportan un brote de SARS-CoV-2 ocurrido en un módulo penitenciario, tras diagnosticar tres casos por TRA, realizan un cribado a un total de 81 reclusos, con una incidencia (por TRA) de infección por SARS-CoV-2 del 11% (9/81). Entre tres y cinco días más tarde un nuevo cribado por PCR en tiempo real (rt-PCR) a los 72 casos inicialmente negativos reporta una positividad del 37% (27/72). Los autores identifican los resultados previos de TRA como falsos negativos, concluyen que dada la baja sensibilidad de los TRA para el cribado del SARS-CoV-2, debería usarse la rt-PCR como técnica preferente. Es vital comprender algunos puntos importantes de las estrategias de cribado con TRA, como la correcta interpretación del resultado, el momento adecuado para realizarlos y las ventajas de estos test sobre la rt-PCR. Los TRA tienen una alta sensibilidad para detectar a las personas con elevada carga viral y potencial de transmisión del virus (sintomáticos y asintomáticos). Esta capacidad está relacionada con la carga viral del paciente, que podría relacionarse con el «cycle threshold» (Ct) de las rt-PCR, un marcador indirecto de la carga viral en un sujeto infectado. Los TRA son eficaces para diagnosticar infectados con Cts < 25, que se correlacionan con virus que crecen en cultivos celulares y son transmisibles3, 4, en estos casos los TRA han demostrado sensibilidades cercanas al 100%. Los TRA por tanto podrían ser frecuentemente negativos a partir del 5° día de clínica (o 10° día de exposición) y universalmente en sujetos con baja carga viral. El control con rt-PCR realizada entre tres y cinco días posteriores al cribado inicial reporta una tasa de positividad del 37% en sujetos con TRA negativo previo. La amplificación de ácidos nucleicos (NAAT) de SARS-CoV-2 con rt-PCR o TMA (transcription-mediated amplification) detecta resultados positivos hasta varios días o semanas, respectivamente, tras la resolución clínica, cuando los sujetos ya no tienen capacidad de generar transmisión. Por tanto, TRA y rt-PCR capturan escenarios distintos de la enfermedad. Los TRA ofrecen resultados positivos durante un período menor de tiempo, con relación a la fase aguda de la infección. Si analizamos la cinética viral del SARS-CoV-2 (fig. 1 ), observamos que las estrategias de cribado frecuente con test de antígenos son igual de eficaces para detectar a las personas contagiosas del virus, que una más espaciada basada en una rt-PCR. La diferencia se debe a las características de cada test, los TRA con test «versátiles» que pueden ser utilizados en cualquier entorno, tienen un coste bajo y tienen la ventaja de dar un resultado en 15 minutos, al contrario de la rt-PCR. Aplicar una estrategia de cribado con TRA podría identificar el mismo número de personas trasmisoras del virus comparada con rt-PCR.
Figura 1

Fases de la infección por SARS-CoV-2.

Fases de la infección por SARS-CoV-2. Volviendo al reporte de Marco et al., sería útil conocer las Cts de las muestras positivas por rt-PCR a los tres y cinco días del testado inicial, sobre todo para saber el real riesgo de contagiosidad de estos pacientes. Las Cts superiores a 25-30 tienen un riesgo bajo de trasmisión viral y una alta probabilidad de resultar negativas en un TRA, con independencia de la presencia o ausencia de síntomas. La negatividad en TRA y positividad en rt-PCR posterior en sujetos ya aislados, básicamente sugiere que el Ct es elevado y estamos capturando la fase final o una infección ya resuelta. Esto es especialmente cierto con TMA, una técnica ultrasensible que detecta hasta 60 copias de SARS-CoV-2 (en lugar de las 3.000-5.000 copias de la rt-PCR). La TMA es la técnica más habitualmente usada en la actualidad en grandes estrategias de cribado, por la posibilidad de agrupar muestras en el laboratorio (pooling) y se puede mantener positiva hasta más allá de las ocho semanas del contagio. En resumen, creemos que TRA y NAAT (rt-PCR o TMA) capturan fenómenos distintos. Cuando se desee identificar de una manera sencilla sujetos con potencial de transmisión de SARS-CoV-2, los TRA son la herramienta idónea. Cuando se desee un cribado para una cohorte transversal que identifique al mayor número posible de sujetos infectados (actual o recientemente), la NAAT será la técnica que capturará el mayor número de casos.

Conflicto de intereses

Los autores declaran no tener ningún conflicto de intereses.
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1.  Rethinking Covid-19 Test Sensitivity - A Strategy for Containment.

Authors:  Michael J Mina; Roy Parker; Daniel B Larremore
Journal:  N Engl J Med       Date:  2020-09-30       Impact factor: 91.245

2.  Evaluation of a novel antigen-based rapid detection test for the diagnosis of SARS-CoV-2 in respiratory samples.

Authors:  Lorena Porte; Paulette Legarraga; Valeska Vollrath; Ximena Aguilera; José M Munita; Rafael Araos; Gabriel Pizarro; Pablo Vial; Mirentxu Iruretagoyena; Sabine Dittrich; Thomas Weitzel
Journal:  Int J Infect Dis       Date:  2020-06-01       Impact factor: 3.623

3.  Improved Molecular Diagnosis of COVID-19 by the Novel, Highly Sensitive and Specific COVID-19-RdRp/Hel Real-Time Reverse Transcription-PCR Assay Validated In Vitro and with Clinical Specimens.

Authors:  Jasper Fuk-Woo Chan; Cyril Chik-Yan Yip; Kelvin Kai-Wang To; Tommy Hing-Cheung Tang; Sally Cheuk-Ying Wong; Kit-Hang Leung; Agnes Yim-Fong Fung; Anthony Chin-Ki Ng; Zijiao Zou; Hoi-Wah Tsoi; Garnet Kwan-Yue Choi; Anthony Raymond Tam; Vincent Chi-Chung Cheng; Kwok-Hung Chan; Owen Tak-Yin Tsang; Kwok-Yung Yuen
Journal:  J Clin Microbiol       Date:  2020-04-23       Impact factor: 5.948

4.  Analytical and clinical performance of the panbio COVID-19 antigen-detecting rapid diagnostic test.

Authors:  Andrea Alemany; Bàrbara Baró; Dan Ouchi; Pau Rodó; Maria Ubals; Marc Corbacho-Monné; Júlia Vergara-Alert; Jordi Rodon; Joaquim Segalés; Cristina Esteban; Gema Fernández; Lidia Ruiz; Quique Bassat; Bonaventura Clotet; Jordi Ara; Martí Vall-Mayans; Camila G-Beiras; Ignacio Blanco; Oriol Mitjà
Journal:  J Infect       Date:  2021-01-07       Impact factor: 6.072

5.  Low sensitivity of rapid antigenic tests as a screening method in an outbreak of SARS-CoV-2 infection in prison.

Authors:  Andrés Marco; Concepció Solé; Indiana J Abdo; Elisabet Turu
Journal:  Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed)       Date:  2021-02-11

6.  Performance of an Antigen-Based Test for Asymptomatic and Symptomatic SARS-CoV-2 Testing at Two University Campuses - Wisconsin, September-October 2020.

Authors:  Ian W Pray; Laura Ford; Devlin Cole; Christine Lee; John Paul Bigouette; Glen R Abedi; Dena Bushman; Miranda J Delahoy; Dustin Currie; Blake Cherney; Marie Kirby; Geroncio Fajardo; Motria Caudill; Kimberly Langolf; Juliana Kahrs; Patrick Kelly; Collin Pitts; Ailam Lim; Nicole Aulik; Azaibi Tamin; Jennifer L Harcourt; Krista Queen; Jing Zhang; Brett Whitaker; Hannah Browne; Magdalena Medrzycki; Patricia Shewmaker; Jennifer Folster; Bettina Bankamp; Michael D Bowen; Natalie J Thornburg; Kimberly Goffard; Brandi Limbago; Allen Bateman; Jacqueline E Tate; Douglas Gieryn; Hannah L Kirking; Ryan Westergaard; Marie Killerby
Journal:  MMWR Morb Mortal Wkly Rep       Date:  2021-01-01       Impact factor: 35.301

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