Beatriz Rosales-Rodríguez1, Juan Carlos Núñez-Enríquez2, Ana Claudia Velázquez-Wong3, Carolina González-Torres4, Javier Gaytán-Cervantes4, Elva Jiménez-Hernández5, Jorge Alfonso Martín-Trejo6, María de Los Ángeles Del Campo-Martínez7, Aurora Medina-Sanson8, Janet Flores-Lujano2, Luz Victoria Flores-Villegas9, José Gabriel Peñaloza-González10, José Refugio Torres-Nava11, Rosa Martha Espinosa-Elizondo12, Raquel Amador-Sánchez13, María Raquel Miranda-Madrazo9, Jessica Denise Santillán-Juárez14, María Luisa Pérez-Saldívar2, Alma Gurrola-Silva15, Darío Orozco-Ruiz11, Karina Anastacia Solís-Labastida6, Martha Margarita Velázquez-Aviña10, David Aldebarán Duarte-Rodríguez2, Minerva Mata-Rocha16, Omar Alejandro Sepúlveda-Robles16, Mónica Ortiz-Maganda17, Vilma Carolina Bekker-Méndez17, Silvia Jiménez-Morales18, Juan Manuel Mejía-Aranguré19, Haydeé Rosas-Vargas20. 1. Programa de Doctorado, Posgrado en Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México; Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 2. Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 3. Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 4. Laboratorio de Secuenciación, División de Desarrollo de la Investigación, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 5. Coordinación de Investigación en Salud, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México; Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General Gaudencio González Garza, Centro Médico Nacional La Raza, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 6. Servicio de Hematología, Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Pediatría, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 7. Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General Gaudencio González Garza, Centro Médico Nacional La Raza, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 8. Servicio de Hemato-Oncología, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Secretaria de Salud, Ciudad de México, México. 9. Servicio de Hematología Pediátrica, Centro Médico Nacional 20 de Noviembre, Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado, Ciudad de México, México. 10. Servicio de Onco-Pediatría, Hospital Juárez de México, Secretaria de Salud, Ciudad de México, México. 11. Servicio de Oncología, Hospital Pediátrico Moctezuma, Secretaría de Salud de la Ciudad de México, Ciudad de México, México. 12. Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General de México, Secretaría de Salud, Ciudad de México, México. 13. Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General Regional No. 1 Dr. Carlos MacGregor Sánchez Navarro, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 14. Servicio de Hemato-Oncología Pediátrica, Hospital Regional No. 1° de Octubre, Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado, Ciudad de México, México. 15. Servicio de Pediatría, Hospital Regional Tipo B de Alta Especialidad Bicentenario de la Independencia, Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado, Ciudad de México, México. 16. Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México; Coordinación de Investigación en Salud, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 17. Unidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología Dr. Daniel Méndez Hernández, Centro Médico Nacional La Raza, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 18. Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Ciudad de México, México. 19. Coordinación de Investigación en Salud, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. 20. Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México. Electronic address: hayrov@gmail.com.
Abstract
BACKGROUND: Refining risk stratification to avoid very early relapses (VER) in Mexican patients with B-lineage acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) could lead to better survival rates in our population. AIM OF THE STUDY: The purpose of this study was to investigate the association between the United Kingdom ALL (UKALL)-CNA classifier and VER risk in Mexican patients with childhood B-ALL. METHODS: A nested case-control study of 25 cases with VER and 38 frequency-matched controls without relapse was conducted within the MIGICCL study cohort. They were grouped into the categories of the UKALL-CNA risk classifier (good [reference], intermediate and poor), according to the results obtained by multiplex ligation dependent probe amplification. Overall and disease-free survival (DFS) were estimated using the Kaplan-Meier method. Univariate and multivariate Cox proportional hazards analyses were conducted. RESULTS: The CDKN2A/B genes were most frequently deleted in the group with relapse. According to UKALL-CNA classifier, 33 (52.4%) patients were classified as good, 21 (33.3%) intermediate and 9 (14.3%) poor-risk B-ALL. The intermediate and poor risk groups were associated with an increased risk of VER (HR = 4.94, 95% CI = 1.87-13.07 and HR = 7.42, 95% CI = 2.37-23.26, respectively) in comparison to the good-risk patients. After adjusting by NCI risk classification and chemotherapy scheme in a multivariate model, the risks remained significant. CONCLUSIONS: Our data support the clinical utility of profiling CNAs to potentially refine current risk stratification strategies of patients with B-ALL.
BACKGROUND: Refining risk stratification to avoid very early relapses (VER) in Mexican patients with B-lineage acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) could lead to better survival rates in our population. AIM OF THE STUDY: The purpose of this study was to investigate the association between the United Kingdom ALL (UKALL)-CNA classifier and VER risk in Mexican patients with childhood B-ALL. METHODS: A nested case-control study of 25 cases with VER and 38 frequency-matched controls without relapse was conducted within the MIGICCL study cohort. They were grouped into the categories of the UKALL-CNA risk classifier (good [reference], intermediate and poor), according to the results obtained by multiplex ligation dependent probe amplification. Overall and disease-free survival (DFS) were estimated using the Kaplan-Meier method. Univariate and multivariate Cox proportional hazards analyses were conducted. RESULTS: The CDKN2A/B genes were most frequently deleted in the group with relapse. According to UKALL-CNA classifier, 33 (52.4%) patients were classified as good, 21 (33.3%) intermediate and 9 (14.3%) poor-risk B-ALL. The intermediate and poor risk groups were associated with an increased risk of VER (HR = 4.94, 95% CI = 1.87-13.07 and HR = 7.42, 95% CI = 2.37-23.26, respectively) in comparison to the good-risk patients. After adjusting by NCI risk classification and chemotherapy scheme in a multivariate model, the risks remained significant. CONCLUSIONS: Our data support the clinical utility of profiling CNAs to potentially refine current risk stratification strategies of patients with B-ALL.