Literature DB >> 32466628

[Urinary tract infection by Acinetobacter dijkshoorniae and good clinical response to treatment].

M I Casanovas Moreno-Torres, F Rodríguez-Campos, M Gutiérrez-Soto, J M Navarro-Marí, J Gutiérrez-Fernández1.   

Abstract

Entities:  

Keywords:  Acinetobacter dijkshoorniae; Urinary tract infection; treatment

Mesh:

Substances:

Year:  2020        PMID: 32466628      PMCID: PMC7374032          DOI: 10.37201/req/011.2020

Source DB:  PubMed          Journal:  Rev Esp Quimioter        ISSN: 0214-3429            Impact factor:   1.553


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Sr. Editor: El complejo Acinetobacter baumannii-calcoaceticus clásicamente estaba formado por cuatro especies diferentes, la ambiental A. calcoaceticus, y las patógenas humanas A. baumannii, A. pitti y A. nosocomialis. Desde el año 2014 se han identificado más de 18 especies nuevas dentro del complejo, entre la que se encuentra recientemente A. dijkshoorniae [1]. Hasta hace poco tiempo, los miembros de este complejo sólo podían diferenciarse mediante métodos moleculares, pero estudios recientes han evaluado el uso de la espectometría de masas (MALDI-TOF MS) para la identificación de las distintas especies del complejo, incluido las nuevas, obteniendo resultados muy fiables [1, 2]. A. dijkshoorniae, llamado así por la microbióloga holandesa Lenie Dijkshoorn, al igual que A. lactucae, está estrechamente relacionada con A. pittii y se le considera un sinónimo heterotípico de aquel [3, 4]. A. dijkshoorniae fue aislada por primera vez de una muestra de orina de un paciente de Turquía en agosto de 2009 y en 2019 se identificó por primera vez en Perú, en carne de consumo humano procedente de un mercado [5]. La identificación correcta y rápida de las diferentes especies del complejo, gracias al uso de MALDITOF, es crucial ya que estas difieren en la susceptibilidad a los antibióticos. Se trata de un hecho clave ya que los brotes producidos por Acinetobacter spp. resistentes cada vez son más frecuentes [2]. Al secuenciar el genoma de A. dijkshoorniae también se han identificado varios genes de resistencia a los antibióticos, como blaNDM-1 y aphA6 [1]. Pero hasta la fecha existe escasa experiencia sobre la patología específica producida por esta nueva especie, pudiendo deberse a que ahora, gracias a MALDI-TOF, se pueden identificar correctamente las diferentes especies dentro del complejo A. baumannii. Nosotros describimos un caso de infección urinaria debido a A. dijkshoorniae. Paciente de 92 años, con antecedentes personales de hernia hiatal, cáncer de próstata tratado con braquiterapia hace 17 años, colecistectomía, aneurisma de aorta abdominal (hallazgo casual no tratado) y estenosis uretral con sondaje permanente, tras cuadro de sepsis por retención urinaria desde hace 2 años. El cuadro clínico que nos ocupa (16/10/2019) cursó con decaimiento general y febrícula de 48 horas de evolución. El paciente fue trasladado a urgencias tras cuadro sincopal, donde se objetivaron signos de infección urinaria (uroanálisis: leucocitos 105.60/μL, hematíes 140.80/μL). Se cursaron urocultivos, se administró 1 g de ceftriaxona i.v. y se procedió al recambio de la sonda urinaria con mejoría clínica a las pocas horas que permitió el alta a domicilio, con tratamiento antibiótico empírico consistente en cefuroxima y fosfomicina. En el urocultivo crecieron más de 100.000 UFC/ml en la placa de cultivo URI-SELECT4 (Bio-Rad, Francia) de unas colonias amarillentas, lisas, convexas y ligeramente opacas a las 24 horas tras incubación a 37ºC, oxidasa negativa y catalasa positiva. Se identificaron correctamente las colonias mediante espectometría de masas (MALDI-TOF MS, Brucker Biotyper, Billerica, MA, USA) como A. dijkshoorniae, con un score de 2.20. La determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) a los diferentes antibióticos se realizó mediante el sistema MicroScan WalkAway (Beckman Coulter, España) y E-test (MIC Test Strip Liofilchem®, Italia). El aislado fue sensible a quinolonas, aminoglucósidos, carbapenémicos, colistina, piperacilina/tazobactam, minociclina, tigeciclina y trimetoprim/sulfametoxazol; y resistente a cefalosporinas de 3ª y 4ª generación y aztreonam. En base a los resultados, se sustituyó la antibioterapia por ciprofloxacino que se mantuvo 10 días (500 mg cada 12 horas, vía oral). Quince días después se realizó urocultivo de control que resultó negativo. Se obtuvo el consentimiento informado verbal del paciente para la presentación del presente caso. A. dijkshoorniae ha sido descrita por primera vez en el laboratorio de Microbiología del Hospital Virgen de las Nieves (Granada), gracias al uso de nuevas tecnologías para la identificación, como MALDI-TOF. En cuanto a la sensibilidad antibiótica, según nuestros resultados, se trató de un aislado clínico bastante sensible a los antibióticos, a diferencia de A. baumannii. En base a lo cual, creemos que las especies de Acinetobacter con perfil de resistencia escaso pueden ser nuevas especies, como la descrita aquí u otras aún no descritas, que presentan menos resistencias que los A. baumannii descritos hasta la fecha [6, 7]. De ahí la gran utilidad e importancia del uso del MALDI-TOF para la identificación correcta de las especies del complejo Acinetobacter.
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1.  Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries.

Authors:  Clara Cosgaya; Marta Marí-Almirall; Ado Van Assche; Dietmar Fernández-Orth; Noraida Mosqueda; Murat Telli; Geert Huys; Paul G Higgins; Harald Seifert; Bart Lievens; Ignasi Roca; Jordi Vila
Journal:  Int J Syst Evol Microbiol       Date:  2016-07-15       Impact factor: 2.747

2.  Pathogenic Acinetobacter species including the novel Acinetobacter dijkshoorniae recovered from market meat in Peru.

Authors:  Marta Marí-Almirall; Clara Cosgaya; Maria J Pons; Alexandr Nemec; Theresa J Ochoa; Joaquim Ruiz; Ignasi Roca; Jordi Vila
Journal:  Int J Food Microbiol       Date:  2019-06-13       Impact factor: 5.277

3.  MALDI-TOF/MS identification of species from the Acinetobacter baumannii (Ab) group revisited: inclusion of the novel A. seifertii and A. dijkshoorniae species.

Authors:  M Marí-Almirall; C Cosgaya; P G Higgins; A Van Assche; M Telli; G Huys; B Lievens; H Seifert; L Dijkshoorn; I Roca; Jordi Vila
Journal:  Clin Microbiol Infect       Date:  2016-12-03       Impact factor: 8.067

4.  Urinary tract infection by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: evolution of antimicrobial resistance and therapeutic alternatives.

Authors:  Gemma Jiménez-Guerra; Victor Heras-Cañas; Miguel Gutiérrez-Soto; María Del Pilar Aznarte-Padial; Manuela Expósito-Ruiz; José María Navarro-Marí; José Gutiérrez-Fernández
Journal:  J Med Microbiol       Date:  2018-06       Impact factor: 2.472

5.  Acinetobacter dijkshoorniae is a later heterotypic synonym of Acinetobacter lactucae.

Authors:  Christopher A Dunlap; Alejandro P Rooney
Journal:  Int J Syst Evol Microbiol       Date:  2018-01       Impact factor: 2.747

6.  Draft Genome Sequence of JVAP01T, the Type Strain of the Novel Species Acinetobacter dijkshoorniae.

Authors:  Dietmar Fernández-Orth; Clara Cosgaya; Murat Telli; Noraida Mosqueda; Marta Marí-Almirall; Ignasi Roca; Jordi Vila
Journal:  Genome Announc       Date:  2017-01-12

7.  Use of WalkAway MicroScan system colistin well when determining the susceptibility of Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii recent clinical isolates.

Authors:  J Borrego-Jiménez; C Soria-Segarra; T D Moldovan; J M Navarro-Marí; J Gutiérrez-Fernández
Journal:  Rev Esp Quimioter       Date:  2020-01-02       Impact factor: 1.553

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Review 1.  Summary of Novel Bacterial Isolates Derived from Human Clinical Specimens and Nomenclature Revisions Published in 2018 and 2019.

Authors:  Erik Munson; Karen C Carroll
Journal:  J Clin Microbiol       Date:  2021-01-21       Impact factor: 5.948

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