Literature DB >> 32228826

[Progress in Role of FEZF1-AS1 in Non-small Cell Lung Cancer].

Jin Chen1, Rong Yin2, Xinyin Liu3.   

Abstract

Nowadays, accumulating evidence indicates that long non-coding RNA (lncRNA) play vital roles in tumorigenesis. As a newly discovered lncRNA, FEZ family zinc finger 1-antisense RNA 1 (FEZF1-AS1) is markedly upregulated in various malignant tumors including non-small cell lung cancer (NSCLC). Aberrant expression of FEZF1-AS1 is related to clinical characteristics of patients with NSCLC and suggests poor prognosis. Moreover, FEZF1-AS1 can regulate numerous biological processes, such as cell proliferation, migration and invasion through different mechanisms. In this article, we systematically summarize the recent research progress of FEZF1-AS1 in NSCLC, which might be a novel target for clinical therapy.

Entities:  

Keywords:  FEZF1-AS1; LncRNA; Lung neoplasms

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Year:  2020        PMID: 32228826      PMCID: PMC7210085          DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2020.101.05

Source DB:  PubMed          Journal:  Zhongguo Fei Ai Za Zhi        ISSN: 1009-3419


近年来肺癌的发病率和死亡率均呈明显上升趋势,据统计[,2018年全球肺癌新增病例约210万,而死亡病例高达176万。根据肺癌的临床和组织病理学特征,可分为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)和小细胞肺癌,其中NSCLC占80%-85%,又分为腺癌、鳞状细胞癌和大细胞肺癌等。NSCLC预后较差,尽管近几年分子靶向治疗和免疫疗法层出不穷,但因为许多患者在发现时已经处于疾病的晚期,5年生存率仍不足20%[,且继发性耐药的产生极大限制了其临床疗效[。因此,深入研究NSCLC发生、发展及耐药的分子机制,寻找早期诊断的生物标志物和有效的治疗靶点,对于改善患者的预后意义深远。 随着生物信息学和分子生物学技术的进步,人们对长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)的研究不断深入,越来越多的证据显示,lncRNA在表观遗传、染色体修饰、转录激活等生物学过程中作为关键调控因子,发挥着重要的作用[。FEZ家族锌指1反义RNA1(FEZ family zinc finger 1-antisense RNA 1, FEZF1-AS1)是一种新发现的lncRNA,在结肠癌、NSCLC、胰腺癌、乳腺癌等多种恶性肿瘤中表达异常,与癌症的发生发展密切相关,在肿瘤的基因诊断、治疗和预后评估等方面有着潜在的应用前景[。本文将结合国内外文献,将FEZF1-AS1NSCLC中的作用机制及研究进展作一阐述,为寻找NSCLC的诊疗方法提供新思路。

LncRNA简介

在人类基因组中超过90%的基因转录为RNA,但无法编码蛋白质,被统称为非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)。LncRNA是一类转录本长度超过200个核苷酸的ncRNA,根据其与相邻编码基因的位置关系可以大致分为正义lncRNA、反义lncRNA、双向lncRNA、基因间lncRNA以及基因内lncRNA几类[。大量研究发现lncRNA参与了表观遗传调控、细胞周期及分化控制、染色质修饰、转录、翻译等一系列生物学过程[。LncRNA的功能与其在细胞内的定位有关,大多数核内lncRNA通过招募DNA甲基化转移酶和组蛋白修饰基因来指导染色质修饰,从而发挥转录抑制作用。此外lncRNA的自身转录也可以调控其附近位点或远处基因的表达。而细胞质中lncRNA主要通过碱基配对调节翻译过程,同时它们还可以作为竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA, ceRNA)结合并阻断特异性的微小RNA(microRNA, miRNA),维持靶mRNA的稳定性。LncRNA可以作为肿瘤促进或抑制因子调节癌细胞的凋亡、增殖和分化能力,并且与肿瘤耐药性密切相关,使其成为当今分子生物学研究的热点[。

FEZF1-AS1在肿瘤中的作用

FEZF1-AS1最早是于2004年由日本学者在分离人类全长cDNA时发现的,它位于人基因组7号染色体7q31.32上,全长2, 653 bp,包含了7个外显子区[。FEZF1-AS1属于反义lncRNA,因其第一个外显子区和FEZF1 mRNA的第一个外显子区存在611个核苷酸的互补配对,从而命名为FEZF1-AS1[。目前已有研究表明,FEZF1-AS1作为癌基因在肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭等过程中起着十分重要的作用。 Gu所在团队[通过高通量测序及癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库分析等方法筛选出了包括FEZF1-AS1在内的9种差异表达基因,并且发现它们对胃腺癌具有潜在的诊断价值。Kaplan-Meier分析显示FEZF1-AS1高表达患者的总生存时间(overall survival, OS)及无复发生存时间(relapse-free survival, RFS)较短。受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)结果表明FEZF1-AS1在胃癌诊断中具有较高的灵敏度和特异性[。Liu等[分别检测了胃癌患者、胃良性病变患者及健康人血清中FEZF1-AS1的表达情况。结果表明,与胃良性病变组和对照组相比,胃癌患者FEZF1-AS1水平显著升高。同时,试者工作特征曲线分析发现FEZF1-AS1灵敏度和特异度明显高于常规肿瘤标志物癌胚抗原(carcinoembryonic antigen, CEA)和糖类抗原19-9(carbohydrate antigen19-9, CA19-9)。联合检测血清FEZF1-AS1、CEA和CA19-9可以增强胃癌诊断的敏感性。此外,他们发现胃癌术后患者血清中FEZF1-AS1水平较术前明显下降。这些结果表明循环FEZF1-AS1可作为胃癌的潜在生物标志物来进行动态监控。在机制方面,Liu等[认为FEZF1-AS1可以通过结合组蛋白去甲基化酶1(lysine specific demethylase 1, LSD1)介导p21的启动子区组蛋白第三亚基四号赖氨酸的二甲基(dimethylation of lysine 4 on histone H3 protein subunit, H3K4me2)去甲基化,在表观遗传学水平上抑制p21表达,从而促进胃癌细胞的增殖。Wu等[则发现沉默FEZF1-AS1后,β-catenin、c-myc和cyclin D1的表达降低,提示FEZF1-AS1可能通过激活Wnt/β-catenin信号通路来促进胃癌的发生和发展。 Chen等[应用qRT-PCR检测到FEZF1-AS1在结直肠癌组织及细胞系中均呈高表达。FEZF1-AS1的表达水平与T分期、淋巴结转移及远处转移密切相关。单因素和多因素分析表明FEZF1-AS1的高表达是结直肠癌的独立预后因素。他们提出FEZF1-AS1主要通过调控细胞周期来促进肿瘤细胞的增殖,且敲低FEZF1-AS1能抑制结直肠癌细胞的迁移和侵袭能力。Bian等[通过裸鼠体内成瘤实验发现FEZF1-AS1能够促进结直肠癌的肺转移及肝转移。蛋白质体外结合(RNA pull-down)实验及质谱分析结果预测丙酮酸激酶M2(pyruvate kinase 2, PKM2)是FEZF1-AS1的相关蛋白,生物学信息分析又发现转录激活因子3(signal transducers and activators of transcription 3, STAT3)可以被FEZF1-AS1PKM2所调控。他们认为FEZF1-AS1可能通过增强PKM2的活性,促进肿瘤细胞的需氧糖酵解,激活STAT3信号通路来影响癌细胞的增殖和转移。 乳腺癌是女性中最常见的恶性肿瘤,严重影响了女性患者健康及生活质量。而FEZF1-AS1在乳腺癌中同样发挥着重要的作用,研究发现FEZF1-AS1可以降低乳腺癌干样细胞的CD44+/CD24-比率和成球能力,且敲低FEZF1-AS1可以减少Nanog、Oct4、Sox2等干细胞因子的表达。进一步的研究[表明,FEZF1-AS1通过与miR-30a结合来调节Nanog蛋白的表达,促进乳腺癌的发生发展。

FEZF1-AS1与NSCLC的预后及发生发展

He及其团队[通过qRT-PCR检测发现,与正常癌旁组织及人肺上皮细胞(16HBE)相比,FEZF1-AS1NSCLC组织和细胞系中的表达显著上调。统计分析表明,FEZF1-AS1的表达水平与淋巴结转移、TNM分期以及肿瘤分化程度正相关。Gong等[检测了160例NSCLC组织及其邻近非肿瘤组织中FEZF1-AS1的表达水平。结果显示,FEZF1-AS1在肿瘤组织中表达显著上调,并且其高表达与更高级别的肿瘤分期和肿瘤家族史有关。刘等[则发现肺腺癌组织中FEZF1-AS1的表达水平与组织学分级和淋巴结转移相关,同时Kaplan-Meier曲线分析结果提示FEZF1-AS1NSCLC的独立预后因素,FEZF1-AS1高表达的患者生存时间显著缩短。 为探索FEZF1-AS1NSCLC中的生物学作用,He等[使用si-RNA敲低了A549SPC-A1细胞中FEZF1-AS1的表达。MTT细胞增殖试验和克隆形成试验证实,与si-NC组相比FEZF1-AS1下调降低了肺癌细胞的细胞增殖能力。此外,Transwell实验表明敲低FEZF1-AS1的表达对肿瘤细胞的侵袭力有着显著的抑制作用。有研究[证实细胞上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)过程与恶性肿瘤的侵袭和转移密切相关。EMT是指上皮细胞丧失细胞极性以及细胞间的黏附连接能力,转化成为具有间质表型的细胞,同时EMT还伴随着关键性上皮性标志物E-钙黏蛋白(E-cadherin)以及间质性标志物波形蛋白(Vimentin)的改变。在Western blot试验中,他们发现FEZF1-AS1可以降低NSCLC细胞中E-cadherin及ZO-1蛋白表达,并增加Slug、Twist和Vimentin的表达水平。而E-cadherin是细胞侵袭和EMT过程中的关键调控因子,表明FEZF1-AS1可以通过抑制EMT促进NSCLC细胞的增殖和侵袭。目前研究普遍认为lncRNA可以通过与RNA结合蛋白作用来调控潜在的靶标。随后He团队进行了RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA binding protein immunoprecipitation, RIP)和染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)实验,结果证实FEZF1-AS1可以直接结合Zeste基因增强子同源物2(enhancer of zeste homolog 2, EZH2)和LSD1,而敲低FEZF1-AS1则会降低EZH2LSD1E-cadherin启动子区域的结合能力,即沉默FEZF1-AS1可以上调E-cadherin的表达。此外,研究还发现FEZF1-AS1表达下调后可以增加A549细胞中Axin1的表达,并降低β-catenin和TCF4的表达,这表明FEZF1-AS1也可以通过调节NSCLC中的Wnt/β-catenin信号传导活性来参与EMT进程。 Jin等[发现沉默FEZF1-AS1可将肺腺癌细胞阻滞在G1期,从而抑制肺癌细胞增殖、促进其凋亡。进一步的研究[表明,在肺癌细胞中敲低FEZF1-AS1p57的表达升高。P57因其对于肿瘤细胞增殖起负性调节作用,而被认为是种抑癌基因。目前已有研究发现,人肺癌中存在着p57基因组印记的缺失,p57可以通过抑制细胞周期蛋白依赖激酶以及增殖细胞核抗原,实现对细胞周期的调控。核质分离实验结果显示,FEZF1-AS1在细胞核中的表达明显高于细胞质,提示FEZF1-AS1可能主要在转录水平发挥作用。随后的RIP实验及RNA pull-down实验证实,FEZF1-AS1能够与RNA结合蛋白EZH2LSD1直接绑定。ChIP测定发现FEZF1-AS1主要通过将EZH2LSD1募集到p57的启动子区域,并诱导组蛋白修饰来调节肺腺癌细胞中的p57表达,从而促进肺癌的发生和发展。 有研究认为反义RNA可以通过直接与互补的mRNA序列结合在转录后水平调节亲本编码基因的表达。Gong等[为探究FEZF1-AS1作为反义RNA是否也存在类似作用机制,检测了58例NSCLC组织中FEZF1-AS1FEZF1的表达水平,发现FEZF1-AS1的表达水平和FEZF1呈正相关。随后研究者又通过GEPIA数据库分析了969例NSCLC患者中FEZF1-AS1FEZF1的表达,并得到了相似的结论。同时他们还发现两者的外显子存在部分重叠,猜测FEZF1-AS1可能通过结合FEZF1基因调节其表达。在胃癌中,有研究指出FEZF1-AS1的启动子区包含一个保守的SP1结合位点,而FEZF1基因启动子区去甲基化,组蛋白乙酰化和转录因子SP1结合可诱导FEZF1基因转录激活,而肺癌中相关的作用机制还有待进一步探讨[。刘等[发现在肺癌细胞中敲低FEZF1-AS1后其有义同源基因FEZF1 mRNA和蛋白的表达均受到抑制。而使用小干扰RNA下调FEZF1基因的表达后FEZF1-AS1的表达水平也明显下降。为了证明FEZF1-AS1FEZF1之间的相互作用,研究者在肺癌细胞系中进行了双荧光素酶报告基因检测,结果表明干扰FEZF1-AS1表达无法改变FEZF1的荧光素酶活性。

FEZF1-AS1与EGFR-TKIs耐药相关的可能机制

肺癌治疗是目前的研究热点,因传统放化疗临床疗效有限,患者5年生存率不足15%。以表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitors, EGFR-TKIs)为代表的分子靶向治疗的出现是肺癌治疗领域突破性的进展,大幅延长了患者的生存期,提高了患者生存质量。在我国约有50%的肺腺癌患者携带有EGFR基因突变,除部分原发耐药患者外(约10%),EGFR-TKIs对于EGFR敏感突变的患者疗效显著。然而随之而来的获得性耐药的产生,成为了临床抗肿瘤治疗的一大难题。常见的耐药机制包括EGFR T790M、c-MET扩增、HER2扩增、BRAF突变及小细胞肺癌转化等,但有约30%的机制仍不明确。有研究[显示lncRNA在耐药细胞及组织中表达异常,为EGFR-TKIs的耐药机制研究提供了新的思路。例如lncRNA UCA1MIR31HG可以通过激活PI3K/AKT信号通路诱导NSCLC细胞对吉非替尼产生耐药性[。BC087858可能通过调控EMT进程在EGFR-TKIs获得性耐药中发挥作用[,而FEZF1-AS1也被证实是这些通路中的重要调节因子。Li等[发现miR-610能够与FEZF1-AS1的3’端非翻译区(3-untranslated region, 3’UTR)结合,且AKT3的表达与miR-610的表达呈负相关。沉默FEZF1-AS1可以降低AKT3 mRNA和蛋白的表达,而FEZF1-AS1AKT3的表达呈正相关,表明FEZF1-AS1可以通过调节miR-610/AKT3轴以促进多发性骨髓瘤细胞的增殖。Wang等[提出JAK2/STAT3信号通路在肝癌细胞EMT进程中起着不可或缺的作用,沉默FEZF1-AS1能够抑制STAT3的磷酸化,且敲低FEZF1-AS1后N-钙粘蛋白(N-cadherin)和Vimentin表达降低,E-cadherin表达升高,从而抑制了EMT过程。然而,FEZF1-AS1EGFR-TKIs耐药中的作用机制仍需进一步深入研究,为实现其临床潜力提供新的理论基础。

总结及展望

综上所述,lncRNA FEZF1-AS1作为一种致癌基因,通过招募多梳抑制复合体、竞争内源性RNA、调控信号通路等方式在NSCLC细胞增殖、侵袭、转移等恶性生物学过程中发挥关键的调节作用。全面深入地了解FEZF1-AS1,也将在NSCLC的诊断、治疗以及预后评估等临床应用中产生重要的价值。
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Review 1.  RNA editing of non-coding RNA and its role in gene regulation.

Authors:  Chammiran Daniel; Jens Lagergren; Marie Öhman
Journal:  Biochimie       Date:  2015-06-05       Impact factor: 4.079

Review 2.  TGF-β signaling and epithelial-mesenchymal transition in cancer progression.

Authors:  Yoko Katsuno; Samy Lamouille; Rik Derynck
Journal:  Curr Opin Oncol       Date:  2013-01       Impact factor: 3.645

3.  Long noncoding RNA FEZF1-AS1 indicates a poor prognosis of gastric cancer and promotes tumorigenesis via activation of Wnt signaling pathway.

Authors:  Xiaoli Wu; Peichen Zhang; Hua Zhu; Shi Li; Xiangjian Chen; Lingyan Shi
Journal:  Biomed Pharmacother       Date:  2017-11-24       Impact factor: 6.529

Review 4.  The Landscape of long noncoding RNA classification.

Authors:  Georges St Laurent; Claes Wahlestedt; Philipp Kapranov
Journal:  Trends Genet       Date:  2015-04-10       Impact factor: 11.639

5.  LncRNA FEZF1-AS1 enhances epithelial-mesenchymal transition (EMT) through suppressing E-cadherin and regulating WNT pathway in non-small cell lung cancer (NSCLC).

Authors:  Rong He; Fei Hu Zhang; Ning Shen
Journal:  Biomed Pharmacother       Date:  2017-09-12       Impact factor: 6.529

6.  Circulatinglong non-coding RNA FEZF1-AS1 and AFAP1-AS1 serve as potential diagnostic biomarkers for gastric cancer.

Authors:  Wenwen Liu; Yi Li; Yan Zhang; Xianjuan Shen; Zhangyao Su; Lin Chen; Weihua Cai; Feng Wang; Shaoqing Ju
Journal:  Pathol Res Pract       Date:  2019-11-22       Impact factor: 3.250

7.  LincRNA FEZF1-AS1 contributes to the proliferation of LAD cells by silencing p57 expression.

Authors:  Shuai Jin; Siyu Chen; Yongfu Ma; Bo Yang; Yang Liu
Journal:  Oncotarget       Date:  2017-09-23

8.  LincRNAFEZF1-AS1 represses p21 expression to promote gastric cancer proliferation through LSD1-Mediated H3K4me2 demethylation.

Authors:  Yan-Wen Liu; Rui Xia; Kai Lu; Min Xie; Fen Yang; Ming Sun; Wei De; Cailian Wang; Guozhong Ji
Journal:  Mol Cancer       Date:  2017-02-16       Impact factor: 27.401

Review 9.  Long non-coding RNA: a new player in cancer.

Authors:  Hua Zhang; Zhenhua Chen; Xinxin Wang; Zunnan Huang; Zhiwei He; Yueqin Chen
Journal:  J Hematol Oncol       Date:  2013-05-31       Impact factor: 17.388

10.  Long non-coding RNA FEZF1-AS1 facilitates cell proliferation and migration in colorectal carcinoma.

Authors:  Na Chen; Dan Guo; Qiong Xu; Minhui Yang; Dan Wang; Man Peng; Yanqing Ding; Shuang Wang; Jun Zhou
Journal:  Oncotarget       Date:  2016-03-08
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