Literature DB >> 21580868

Penta-carbonyl-1κC,2κC-(ferrocenyl-diphenyl-phosphine-1κP)[μ-2-(4-methyl-phen-yl)-2-aza-propane-1,3-dithiol-ato-1:2κS,S':S,S']diiron(I)(Fe-Fe).

Yan-Feng Tang1, Jin-Li Zhu.   

Abstract

The title compound, [Fe(2)(C(9)H(11)NS(2)){Fe(C(5)H(5))(C(17)H(14)P)}(CO)(5)], was prepared as an aza-dithiol-ato-iron model for the iron-only hydrogenase active site. The Fe(2)S(2) unit exhibits a butterfly conformation and the ferrocenyldiphenyl-phosphine ligand is trans to the Fe-Fe bond. The Fe-Fe distance of 2.5160 (8) Å is longer than found in related model structures. Intra-molecular C-H⋯S and inter-molecular C-H⋯O hydrogen bonds are observed.

Entities:  

Year:  2008        PMID: 21580868      PMCID: PMC2959581          DOI: 10.1107/S1600536808032698

Source DB:  PubMed          Journal:  Acta Crystallogr Sect E Struct Rep Online        ISSN: 1600-5368


Related literature

For general background, see: Cammack (1999 ▶); Evans & Pickett (2003 ▶); Nicolet et al. (1999 ▶); Peters et al. (1998 ▶). For related structures, see: Hou et al. (2006 ▶); Lawrence et al. (2001 ▶); Ott et al. (2004 ▶).

Experimental

Crystal data

[Fe3(C5H5)(C9H11NS2)(C17H14P)(CO)5] M = 819.25 Monoclinic, a = 13.600 (2) Å b = 10.8964 (19) Å c = 23.396 (4) Å β = 94.741 (3)° V = 3455.2 (11) Å3 Z = 4 Mo Kα radiation μ = 1.45 mm−1 T = 298 (2) K 0.20 × 0.20 × 0.10 mm

Data collection

Bruker SMART APEX CCD area-detector diffractometer Absorption correction: multi-scan (SADABS; Bruker, 1997 ▶) T min = 0.760, T max = 0.868 21457 measured reflections 8202 independent reflections 4258 reflections with I > 2σ(I) R int = 0.070

Refinement

R[F 2 > 2σ(F 2)] = 0.048 wR(F 2) = 0.079 S = 0.80 8202 reflections 434 parameters H-atom parameters constrained Δρmax = 0.66 e Å−3 Δρmin = −0.39 e Å−3 Data collection: SMART (Bruker, 1997 ▶); cell refinement: SAINT-Plus (Bruker, 2001 ▶); data reduction: SAINT-Plus; program(s) used to solve structure: SHELXS97 (Sheldrick, 2008 ▶); program(s) used to refine structure: SHELXL97 (Sheldrick, 2008 ▶); molecular graphics: SHELXTL (Sheldrick, 2008 ▶); software used to prepare material for publication: SHELXL97. Crystal structure: contains datablocks global, I. DOI: 10.1107/S1600536808032698/ci2685sup1.cif Structure factors: contains datablocks I. DOI: 10.1107/S1600536808032698/ci2685Isup2.hkl Additional supplementary materials: crystallographic information; 3D view; checkCIF report
[Fe3(C5H5)(C9H11NS2)(C17H14P)(CO)5]F(000) = 1672
Mr = 819.25Dx = 1.575 Mg m3
Monoclinic, P21/cMo Kα radiation, λ = 0.71073 Å
Hall symbol: -P 2ybcCell parameters from 2549 reflections
a = 13.600 (2) Åθ = 2.4–22.0°
b = 10.8964 (19) ŵ = 1.45 mm1
c = 23.396 (4) ÅT = 298 K
β = 94.741 (3)°Block, red
V = 3455.2 (11) Å30.20 × 0.20 × 0.10 mm
Z = 4
Bruker SMART APEX CCD area-detector diffractometer8202 independent reflections
Radiation source: fine-focus sealed tube4258 reflections with I > 2σ(I)
graphiteRint = 0.070
φ and ω scansθmax = 28.4°, θmin = 1.5°
Absorption correction: multi-scan (SADABS; Bruker, 1997)h = −17→18
Tmin = 0.760, Tmax = 0.868k = −9→14
21457 measured reflectionsl = −31→30
Refinement on F20 restraints
Least-squares matrix: fullH-atom parameters constrained
R[F2 > 2σ(F2)] = 0.048w = 1/[σ2(Fo2) + (0.0157P)2] where P = (Fo2 + 2Fc2)/3
wR(F2) = 0.079(Δ/σ)max = 0.001
S = 0.80Δρmax = 0.66 e Å3
8202 reflectionsΔρmin = −0.38 e Å3
434 parameters
Geometry. All e.s.d.'s (except the e.s.d. in the dihedral angle between two l.s. planes) are estimated using the full covariance matrix. The cell e.s.d.'s are taken into account individually in the estimation of e.s.d.'s in distances, angles and torsion angles; correlations between e.s.d.'s in cell parameters are only used when they are defined by crystal symmetry. An approximate (isotropic) treatment of cell e.s.d.'s is used for estimating e.s.d.'s involving l.s. planes.
Refinement. Refinement of F^2^ against ALL reflections. The weighted R-factor wR and goodness of fit S are based on F^2^, conventional R-factors R are based on F, with F set to zero for negative F^2^. The threshold expression of F^2^ > σ(F^2^) is used only for calculating R-factors(gt) etc. and is not relevant to the choice of reflections for refinement. R-factors based on F^2^ are statistically about twice as large as those based on F, and R- factors based on ALL data will be even larger.
xyzUiso*/Ueq
Fe10.20737 (4)0.18453 (5)0.30929 (2)0.03252 (14)
Fe20.20176 (4)0.09491 (5)0.40808 (2)0.03988 (16)
Fe30.08083 (4)0.09519 (5)0.11522 (2)0.04244 (16)
S10.34466 (7)0.12772 (9)0.36528 (4)0.0387 (2)
S20.15575 (7)−0.00994 (9)0.32718 (4)0.0382 (2)
P10.26239 (7)0.19707 (9)0.22109 (4)0.0316 (2)
O10.2115 (2)−0.1033 (3)0.49363 (13)0.0791 (11)
O20.2652 (3)0.3021 (3)0.48103 (14)0.1006 (13)
O3−0.0037 (2)0.1481 (3)0.42412 (14)0.0962 (12)
O40.2502 (2)0.4345 (2)0.34576 (12)0.0634 (9)
O50.0021 (2)0.2479 (3)0.27912 (12)0.0661 (9)
N10.3407 (2)−0.1259 (3)0.34951 (12)0.0409 (8)
C10.4517 (4)−0.3802 (4)0.56016 (18)0.0874 (16)
H1A0.4496−0.46710.55350.131*
H1B0.4066−0.35920.58810.131*
H1C0.5173−0.35660.57410.131*
C20.4224 (3)−0.3132 (4)0.50438 (17)0.0536 (11)
C30.3533 (3)−0.3595 (4)0.46376 (18)0.0529 (11)
H30.3241−0.43480.47060.063*
C40.3255 (3)−0.2992 (4)0.41345 (16)0.0459 (10)
H40.2792−0.33460.38700.055*
C50.3662 (3)−0.1853 (4)0.40172 (16)0.0394 (9)
C60.4364 (3)−0.1384 (4)0.44210 (17)0.0485 (11)
H60.4658−0.06340.43530.058*
C70.4635 (3)−0.2009 (4)0.49226 (17)0.0579 (12)
H70.5107−0.16670.51860.069*
C80.2455 (3)−0.1362 (3)0.31877 (16)0.0479 (11)
H8A0.2156−0.21210.33040.057*
H8B0.2551−0.14360.27830.057*
C90.3917 (3)−0.0175 (3)0.33541 (15)0.0448 (10)
H9A0.3883−0.01030.29400.054*
H9B0.4606−0.02660.34900.054*
C100.2131 (3)−0.0291 (4)0.45986 (18)0.0539 (12)
C110.2391 (3)0.2194 (4)0.45270 (18)0.0651 (14)
C120.0758 (3)0.1262 (4)0.41723 (17)0.0561 (12)
C130.2339 (3)0.3362 (4)0.32971 (15)0.0385 (10)
C140.0838 (3)0.2218 (3)0.28947 (16)0.0431 (10)
C150.0207 (4)0.2515 (5)0.0789 (2)0.0749 (15)
H150.05680.31960.06300.090*
C16−0.0165 (4)0.1463 (5)0.0488 (2)0.0738 (15)
H16−0.01010.12870.00810.089*
C17−0.0633 (3)0.0727 (5)0.0861 (2)0.0736 (15)
H17−0.0958−0.00580.07660.088*
C18−0.0557 (3)0.1293 (5)0.1406 (2)0.0686 (14)
H18−0.08260.09790.17540.082*
C19−0.0044 (3)0.2407 (4)0.1355 (2)0.0662 (14)
H190.01150.29990.16640.079*
C200.1400 (3)−0.0774 (4)0.12177 (17)0.0518 (11)
H200.1039−0.15460.11520.062*
C210.1848 (3)−0.0097 (4)0.08032 (18)0.0551 (12)
H210.1854−0.03120.03970.066*
C220.2278 (3)0.0960 (4)0.10657 (15)0.0440 (10)
H220.26380.15980.08740.053*
C230.2103 (2)0.0944 (3)0.16603 (14)0.0331 (9)
C240.1549 (3)−0.0139 (3)0.17502 (16)0.0429 (10)
H240.1310−0.04010.21150.051*
C250.3951 (2)0.1685 (3)0.22119 (14)0.0303 (8)
C260.4591 (3)0.2380 (3)0.25719 (15)0.0380 (9)
H260.43380.29980.27910.046*
C270.5593 (3)0.2175 (4)0.26120 (16)0.0471 (11)
H270.60110.26500.28570.056*
C280.5975 (3)0.1257 (4)0.22858 (17)0.0483 (11)
H280.66500.11030.23150.058*
C290.5357 (3)0.0582 (3)0.19212 (16)0.0455 (11)
H290.5618−0.00150.16930.055*
C300.4351 (3)0.0770 (3)0.18864 (15)0.0370 (9)
H300.39370.02830.16450.044*
C310.2548 (3)0.3488 (3)0.18691 (15)0.0343 (9)
C320.3189 (3)0.3814 (3)0.14616 (16)0.0477 (11)
H320.36770.32660.13710.057*
C330.3115 (3)0.4942 (4)0.11883 (17)0.0577 (12)
H330.35440.51410.09130.069*
C340.2412 (3)0.5761 (4)0.13229 (18)0.0591 (12)
H340.23640.65190.11400.071*
C350.1777 (3)0.5472 (4)0.17249 (18)0.0547 (12)
H350.13010.60340.18170.066*
C360.1843 (3)0.4339 (3)0.19954 (15)0.0427 (10)
H360.14050.41480.22670.051*
U11U22U33U12U13U23
Fe10.0317 (3)0.0340 (3)0.0323 (3)−0.0013 (3)0.0052 (2)−0.0022 (2)
Fe20.0415 (4)0.0483 (4)0.0305 (3)−0.0029 (3)0.0065 (3)−0.0030 (3)
Fe30.0349 (3)0.0523 (4)0.0393 (3)0.0000 (3)−0.0020 (3)−0.0046 (3)
S10.0357 (6)0.0427 (6)0.0374 (6)−0.0044 (5)0.0019 (5)0.0000 (5)
S20.0405 (6)0.0395 (6)0.0343 (6)−0.0058 (5)0.0014 (5)0.0002 (4)
P10.0296 (5)0.0336 (6)0.0319 (6)0.0006 (5)0.0038 (4)−0.0019 (4)
O10.103 (3)0.087 (3)0.051 (2)0.012 (2)0.0248 (19)0.0228 (18)
O20.138 (3)0.099 (3)0.067 (3)−0.033 (3)0.026 (2)−0.042 (2)
O30.055 (2)0.151 (4)0.084 (3)0.020 (2)0.018 (2)−0.018 (2)
O40.067 (2)0.046 (2)0.079 (2)−0.0107 (16)0.0131 (17)−0.0186 (16)
O50.0356 (18)0.080 (2)0.083 (2)0.0090 (16)0.0092 (17)0.0150 (17)
N10.049 (2)0.038 (2)0.036 (2)0.0013 (16)0.0032 (17)0.0055 (15)
C10.098 (4)0.094 (4)0.067 (4)−0.003 (3)−0.013 (3)0.034 (3)
C20.056 (3)0.057 (3)0.047 (3)0.001 (2)0.002 (2)0.018 (2)
C30.055 (3)0.047 (3)0.058 (3)−0.009 (2)0.010 (2)0.012 (2)
C40.049 (3)0.044 (3)0.043 (3)−0.006 (2)−0.002 (2)−0.001 (2)
C50.041 (2)0.040 (3)0.037 (2)0.004 (2)0.0059 (19)0.0015 (19)
C60.042 (3)0.049 (3)0.054 (3)−0.007 (2)−0.001 (2)0.014 (2)
C70.050 (3)0.062 (3)0.059 (3)−0.004 (2)−0.011 (2)0.008 (2)
C80.063 (3)0.035 (3)0.044 (3)0.001 (2)−0.006 (2)−0.0051 (19)
C90.044 (2)0.046 (3)0.046 (3)0.012 (2)0.014 (2)0.009 (2)
C100.045 (3)0.080 (4)0.039 (3)0.002 (2)0.016 (2)−0.006 (2)
C110.072 (3)0.083 (4)0.043 (3)−0.010 (3)0.022 (3)−0.013 (3)
C120.056 (3)0.074 (3)0.039 (3)0.002 (3)0.005 (2)−0.006 (2)
C130.032 (2)0.044 (3)0.040 (2)0.004 (2)0.0056 (18)−0.004 (2)
C140.045 (3)0.037 (3)0.050 (3)−0.006 (2)0.012 (2)0.0042 (19)
C150.073 (4)0.067 (4)0.082 (4)0.013 (3)−0.011 (3)0.016 (3)
C160.065 (4)0.094 (5)0.058 (3)0.017 (3)−0.021 (3)−0.009 (3)
C170.038 (3)0.087 (4)0.093 (4)−0.001 (3)−0.016 (3)−0.020 (3)
C180.035 (3)0.098 (4)0.073 (4)0.004 (3)0.005 (2)−0.013 (3)
C190.045 (3)0.071 (4)0.080 (4)0.020 (3)−0.012 (3)−0.021 (3)
C200.055 (3)0.042 (3)0.056 (3)−0.001 (2)−0.011 (2)−0.013 (2)
C210.047 (3)0.076 (3)0.042 (3)0.003 (2)0.002 (2)−0.024 (2)
C220.038 (2)0.058 (3)0.036 (2)−0.005 (2)0.0070 (19)−0.006 (2)
C230.030 (2)0.037 (2)0.032 (2)0.0003 (18)0.0013 (17)−0.0005 (18)
C240.046 (3)0.045 (3)0.036 (2)−0.002 (2)−0.001 (2)−0.0014 (19)
C250.030 (2)0.032 (2)0.030 (2)0.0019 (17)0.0070 (17)0.0068 (16)
C260.037 (2)0.036 (2)0.042 (2)−0.0003 (19)0.010 (2)−0.0054 (18)
C270.036 (2)0.052 (3)0.052 (3)−0.010 (2)−0.003 (2)0.001 (2)
C280.025 (2)0.059 (3)0.061 (3)0.006 (2)0.004 (2)0.009 (2)
C290.039 (3)0.046 (3)0.053 (3)0.012 (2)0.015 (2)0.000 (2)
C300.037 (2)0.036 (2)0.038 (2)0.0036 (18)0.0033 (18)0.0005 (18)
C310.032 (2)0.035 (2)0.036 (2)0.0001 (17)0.0041 (18)0.0048 (17)
C320.042 (3)0.049 (3)0.053 (3)0.013 (2)0.007 (2)0.014 (2)
C330.053 (3)0.065 (3)0.057 (3)0.006 (3)0.014 (2)0.027 (2)
C340.060 (3)0.050 (3)0.067 (3)0.008 (2)−0.001 (3)0.023 (2)
C350.054 (3)0.045 (3)0.065 (3)0.021 (2)0.004 (2)0.009 (2)
C360.036 (2)0.050 (3)0.043 (2)0.008 (2)0.0061 (19)0.001 (2)
Fe1—C131.750 (4)C7—H70.93
Fe1—C141.754 (4)C8—H8A0.97
Fe1—P12.2565 (10)C8—H8B0.97
Fe1—S12.2762 (11)C9—H9A0.97
Fe1—S22.2818 (11)C9—H9B0.97
Fe1—Fe22.5160 (8)C15—C191.399 (5)
Fe2—C111.761 (5)C15—C161.417 (6)
Fe2—C121.777 (5)C15—H150.98
Fe2—C101.813 (5)C16—C171.379 (6)
Fe2—S22.2546 (11)C16—H160.98
Fe2—S12.2867 (11)C17—C181.413 (6)
Fe3—C222.025 (4)C17—H170.98
Fe3—C182.030 (4)C18—C191.410 (5)
Fe3—C162.034 (4)C18—H180.98
Fe3—C172.036 (4)C19—H190.98
Fe3—C242.038 (4)C20—C211.398 (5)
Fe3—C212.040 (4)C20—C241.425 (5)
Fe3—C232.041 (3)C20—H200.98
Fe3—C192.043 (4)C21—C221.409 (5)
Fe3—C152.044 (4)C21—H210.98
Fe3—C202.047 (4)C22—C231.431 (4)
S1—C91.864 (3)C22—H220.98
S2—C81.860 (4)C23—C241.425 (4)
P1—C231.806 (3)C24—H240.98
P1—C251.832 (3)C25—C261.385 (4)
P1—C311.836 (3)C25—C301.392 (4)
O1—C101.132 (4)C26—C271.376 (5)
O2—C111.157 (4)C26—H260.93
O3—C121.132 (4)C27—C281.385 (5)
O4—C131.151 (4)C27—H270.93
O5—C141.153 (4)C28—C291.363 (5)
N1—C51.400 (4)C28—H280.93
N1—C91.421 (4)C29—C301.380 (5)
N1—C81.433 (4)C29—H290.93
C1—C21.519 (5)C30—H300.93
C1—H1A0.96C31—C361.382 (4)
C1—H1B0.96C31—C321.391 (4)
C1—H1C0.96C32—C331.386 (5)
C2—C31.376 (5)C32—H320.93
C2—C71.385 (5)C33—C341.363 (5)
C3—C41.374 (5)C33—H330.93
C3—H30.93C34—C351.364 (5)
C4—C51.396 (5)C34—H340.93
C4—H40.93C35—C361.386 (4)
C5—C61.384 (5)C35—H350.93
C6—C71.381 (5)C36—H360.93
C6—H60.93
C13—Fe1—C1491.41 (17)N1—C8—S2117.6 (2)
C13—Fe1—P196.67 (12)N1—C8—H8A107.9
C14—Fe1—P197.31 (12)S2—C8—H8A107.9
C13—Fe1—S187.66 (12)N1—C8—H8B107.9
C14—Fe1—S1159.67 (12)S2—C8—H8B107.9
P1—Fe1—S1102.97 (4)H8A—C8—H8B107.2
C13—Fe1—S2152.46 (12)N1—C9—S1115.4 (2)
C14—Fe1—S287.77 (12)N1—C9—H9A108.4
P1—Fe1—S2110.75 (4)S1—C9—H9A108.4
S1—Fe1—S283.80 (4)N1—C9—H9B108.4
C13—Fe1—Fe297.87 (12)S1—C9—H9B108.4
C14—Fe1—Fe2103.39 (12)H9A—C9—H9B107.5
P1—Fe1—Fe2154.30 (4)O1—C10—Fe2173.4 (4)
S1—Fe1—Fe256.73 (3)O2—C11—Fe2178.3 (4)
S2—Fe1—Fe255.80 (3)O3—C12—Fe2178.3 (4)
C11—Fe2—C1290.8 (2)O4—C13—Fe1176.7 (3)
C11—Fe2—C10100.0 (2)O5—C14—Fe1176.7 (4)
C12—Fe2—C1095.26 (18)C19—C15—C16107.3 (5)
C11—Fe2—S2159.16 (15)C19—C15—Fe369.9 (3)
C12—Fe2—S289.71 (14)C16—C15—Fe369.3 (3)
C10—Fe2—S2100.70 (14)C19—C15—H15126.3
C11—Fe2—S185.74 (13)C16—C15—H15126.4
C12—Fe2—S1152.32 (14)Fe3—C15—H15126.4
C10—Fe2—S1112.39 (13)C17—C16—C15108.7 (5)
S2—Fe2—S184.18 (4)C17—C16—Fe370.3 (3)
C11—Fe2—Fe1102.51 (14)C15—C16—Fe370.0 (3)
C12—Fe2—Fe197.99 (13)C17—C16—H16125.6
C10—Fe2—Fe1153.62 (13)C15—C16—H16125.7
S2—Fe2—Fe156.83 (3)Fe3—C16—H16125.6
S1—Fe2—Fe156.34 (3)C16—C17—C18108.3 (5)
C22—Fe3—C18164.24 (18)C16—C17—Fe370.1 (3)
C22—Fe3—C16120.53 (19)C18—C17—Fe369.5 (2)
C18—Fe3—C1667.69 (19)C16—C17—H17126.0
C22—Fe3—C17153.86 (18)C18—C17—H17125.7
C18—Fe3—C1740.67 (16)Fe3—C17—H17125.8
C16—Fe3—C1739.61 (17)C19—C18—C17107.4 (4)
C22—Fe3—C2468.59 (15)C19—C18—Fe370.2 (2)
C18—Fe3—C24108.54 (17)C17—C18—Fe369.9 (2)
C16—Fe3—C24159.7 (2)C19—C18—H18126.3
C17—Fe3—C24124.54 (19)C17—C18—H18126.3
C22—Fe3—C2140.55 (13)Fe3—C18—H18126.3
C18—Fe3—C21154.22 (19)C15—C19—C18108.4 (4)
C16—Fe3—C21106.06 (18)C15—C19—Fe370.0 (2)
C17—Fe3—C21118.59 (18)C18—C19—Fe369.3 (2)
C24—Fe3—C2168.17 (16)C15—C19—H19125.9
C22—Fe3—C2341.20 (12)C18—C19—H19125.8
C18—Fe3—C23126.57 (17)Fe3—C19—H19126.0
C16—Fe3—C23157.2 (2)C21—C20—C24108.1 (4)
C17—Fe3—C23162.63 (19)C21—C20—Fe369.8 (2)
C24—Fe3—C2340.89 (12)C24—C20—Fe369.3 (2)
C21—Fe3—C2368.77 (14)C21—C20—H20125.8
C22—Fe3—C19127.14 (18)C24—C20—H20126.0
C18—Fe3—C1940.50 (15)Fe3—C20—H20126.1
C16—Fe3—C1967.59 (18)C20—C21—C22108.5 (4)
C17—Fe3—C1967.78 (18)C20—C21—Fe370.2 (2)
C24—Fe3—C19123.45 (18)C22—C21—Fe369.1 (2)
C21—Fe3—C19162.4 (2)C20—C21—H21125.9
C23—Fe3—C19110.29 (16)C22—C21—H21125.6
C22—Fe3—C15108.63 (18)Fe3—C21—H21125.7
C18—Fe3—C1567.97 (19)C21—C22—C23108.5 (3)
C16—Fe3—C1540.67 (16)C21—C22—Fe370.3 (2)
C17—Fe3—C1567.7 (2)C23—C22—Fe370.00 (19)
C24—Fe3—C15158.38 (19)C21—C22—H22125.9
C21—Fe3—C15124.6 (2)C23—C22—H22125.6
C23—Fe3—C15122.80 (18)Fe3—C22—H22125.7
C19—Fe3—C1540.03 (16)C24—C23—C22106.6 (3)
C22—Fe3—C2068.06 (16)C24—C23—P1126.1 (3)
C18—Fe3—C20120.63 (19)C22—C23—P1126.8 (3)
C16—Fe3—C20122.40 (18)C24—C23—Fe369.4 (2)
C17—Fe3—C20106.01 (18)C22—C23—Fe368.8 (2)
C24—Fe3—C2040.84 (13)P1—C23—Fe3132.96 (18)
C21—Fe3—C2040.00 (14)C23—C24—C20108.2 (3)
C23—Fe3—C2068.76 (14)C23—C24—Fe369.7 (2)
C19—Fe3—C20157.4 (2)C20—C24—Fe369.9 (2)
C15—Fe3—C20159.8 (2)C23—C24—H24125.9
C9—S1—Fe1107.79 (13)C20—C24—H24125.9
C9—S1—Fe2111.20 (12)Fe3—C24—H24125.9
Fe1—S1—Fe266.93 (3)C26—C25—C30118.0 (3)
C8—S2—Fe2108.94 (12)C26—C25—P1118.5 (3)
C8—S2—Fe1116.93 (13)C30—C25—P1123.4 (3)
Fe2—S2—Fe167.37 (3)C27—C26—C25121.5 (3)
C23—P1—C25102.96 (16)C27—C26—H26119.3
C23—P1—C31104.03 (16)C25—C26—H26119.3
C25—P1—C31100.01 (15)C26—C27—C28119.6 (4)
C23—P1—Fe1118.32 (12)C26—C27—H27120.2
C25—P1—Fe1112.95 (11)C28—C27—H27120.2
C31—P1—Fe1116.22 (12)C29—C28—C27119.7 (4)
C5—N1—C9119.7 (3)C29—C28—H28120.2
C5—N1—C8123.4 (3)C27—C28—H28120.2
C9—N1—C8112.7 (3)C28—C29—C30120.9 (4)
C2—C1—H1A109.5C28—C29—H29119.5
C2—C1—H1B109.5C30—C29—H29119.5
H1A—C1—H1B109.5C29—C30—C25120.3 (4)
C2—C1—H1C109.5C29—C30—H30119.9
H1A—C1—H1C109.5C25—C30—H30119.9
H1B—C1—H1C109.5C36—C31—C32117.4 (3)
C3—C2—C7116.6 (4)C36—C31—P1121.7 (3)
C3—C2—C1122.2 (4)C32—C31—P1120.8 (3)
C7—C2—C1121.2 (4)C33—C32—C31121.1 (4)
C4—C3—C2122.7 (4)C33—C32—H32119.4
C4—C3—H3118.7C31—C32—H32119.4
C2—C3—H3118.7C34—C33—C32120.0 (4)
C3—C4—C5120.6 (4)C34—C33—H33120.0
C3—C4—H4119.7C32—C33—H33120.0
C5—C4—H4119.7C33—C34—C35120.3 (4)
C6—C5—C4117.1 (4)C33—C34—H34119.9
C6—C5—N1122.2 (4)C35—C34—H34119.9
C4—C5—N1120.6 (4)C34—C35—C36120.0 (4)
C7—C6—C5121.3 (4)C34—C35—H35120.0
C7—C6—H6119.4C36—C35—H35120.0
C5—C6—H6119.4C31—C36—C35121.3 (4)
C6—C7—C2121.7 (4)C31—C36—H36119.4
C6—C7—H7119.1C35—C36—H36119.4
C2—C7—H7119.1
C13—Fe1—Fe2—C11−5.79 (19)C20—Fe3—C18—C17−78.6 (3)
C14—Fe1—Fe2—C11−99.1 (2)C16—C15—C19—C180.7 (5)
P1—Fe1—Fe2—C11118.10 (17)Fe3—C15—C19—C18−58.8 (3)
S1—Fe1—Fe2—C1176.16 (16)C16—C15—C19—Fe359.5 (3)
S2—Fe1—Fe2—C11−177.00 (16)C17—C18—C19—C15−1.0 (5)
C13—Fe1—Fe2—C1286.84 (18)Fe3—C18—C19—C1559.3 (3)
C14—Fe1—Fe2—C12−6.51 (19)C17—C18—C19—Fe3−60.3 (3)
P1—Fe1—Fe2—C12−149.28 (16)C22—Fe3—C19—C1573.8 (3)
S1—Fe1—Fe2—C12168.78 (14)C18—Fe3—C19—C15−119.7 (4)
S2—Fe1—Fe2—C12−84.38 (14)C16—Fe3—C19—C15−38.3 (3)
C13—Fe1—Fe2—C10−153.7 (3)C17—Fe3—C19—C15−81.3 (3)
C14—Fe1—Fe2—C10112.9 (3)C24—Fe3—C19—C15161.0 (3)
P1—Fe1—Fe2—C10−29.8 (3)C21—Fe3—C19—C1533.6 (7)
S1—Fe1—Fe2—C10−71.8 (3)C23—Fe3—C19—C15117.2 (3)
S2—Fe1—Fe2—C1035.1 (3)C20—Fe3—C19—C15−159.5 (4)
C13—Fe1—Fe2—S2171.21 (12)C22—Fe3—C19—C18−166.5 (3)
C14—Fe1—Fe2—S277.86 (13)C16—Fe3—C19—C1881.4 (3)
P1—Fe1—Fe2—S2−64.90 (8)C17—Fe3—C19—C1838.4 (3)
S1—Fe1—Fe2—S2−106.84 (4)C24—Fe3—C19—C18−79.2 (3)
C13—Fe1—Fe2—S1−81.95 (12)C21—Fe3—C19—C18153.3 (5)
C14—Fe1—Fe2—S1−175.30 (13)C23—Fe3—C19—C18−123.0 (3)
P1—Fe1—Fe2—S141.94 (8)C15—Fe3—C19—C18119.7 (4)
S2—Fe1—Fe2—S1106.84 (4)C20—Fe3—C19—C18−39.7 (6)
C13—Fe1—S1—C9−152.98 (16)C22—Fe3—C20—C21−37.4 (2)
C14—Fe1—S1—C9119.3 (4)C18—Fe3—C20—C21157.3 (3)
P1—Fe1—S1—C9−56.67 (12)C16—Fe3—C20—C2175.7 (3)
S2—Fe1—S1—C953.25 (12)C17—Fe3—C20—C21115.6 (3)
Fe2—Fe1—S1—C9106.02 (12)C24—Fe3—C20—C21−119.6 (3)
C13—Fe1—S1—Fe2101.00 (11)C23—Fe3—C20—C21−81.9 (2)
C14—Fe1—S1—Fe213.3 (4)C19—Fe3—C20—C21−173.9 (4)
P1—Fe1—S1—Fe2−162.70 (4)C15—Fe3—C20—C2147.0 (6)
S2—Fe1—S1—Fe2−52.78 (3)C22—Fe3—C20—C2482.2 (2)
C11—Fe2—S1—C9150.9 (2)C18—Fe3—C20—C24−83.1 (3)
C12—Fe2—S1—C9−125.5 (3)C16—Fe3—C20—C24−164.7 (3)
C10—Fe2—S1—C951.8 (2)C17—Fe3—C20—C24−124.8 (3)
S2—Fe2—S1—C9−47.37 (13)C21—Fe3—C20—C24119.6 (3)
Fe1—Fe2—S1—C9−101.01 (13)C23—Fe3—C20—C2437.7 (2)
C11—Fe2—S1—Fe1−108.09 (16)C19—Fe3—C20—C24−54.3 (5)
C12—Fe2—S1—Fe1−24.5 (3)C15—Fe3—C20—C24166.6 (5)
C10—Fe2—S1—Fe1152.84 (15)C24—C20—C21—C22−0.1 (5)
S2—Fe2—S1—Fe153.64 (3)Fe3—C20—C21—C2258.7 (3)
C11—Fe2—S2—C8120.3 (4)C24—C20—C21—Fe3−58.8 (3)
C12—Fe2—S2—C8−148.17 (19)C22—Fe3—C21—C20119.9 (4)
C10—Fe2—S2—C8−52.87 (18)C18—Fe3—C21—C20−49.8 (5)
S1—Fe2—S2—C858.87 (13)C16—Fe3—C21—C20−121.6 (3)
Fe1—Fe2—S2—C8112.07 (13)C17—Fe3—C21—C20−80.8 (3)
C11—Fe2—S2—Fe18.2 (4)C24—Fe3—C21—C2037.8 (2)
C12—Fe2—S2—Fe199.76 (14)C23—Fe3—C21—C2081.9 (2)
C10—Fe2—S2—Fe1−164.94 (13)C19—Fe3—C21—C20172.2 (5)
S1—Fe2—S2—Fe1−53.20 (3)C15—Fe3—C21—C20−162.2 (3)
C13—Fe1—S2—C8−119.6 (3)C18—Fe3—C21—C22−169.7 (4)
C14—Fe1—S2—C8151.61 (18)C16—Fe3—C21—C22118.5 (3)
P1—Fe1—S2—C854.64 (14)C17—Fe3—C21—C22159.3 (3)
S1—Fe1—S2—C8−46.91 (14)C24—Fe3—C21—C22−82.1 (3)
Fe2—Fe1—S2—C8−100.52 (14)C23—Fe3—C21—C22−38.0 (2)
C13—Fe1—S2—Fe2−19.1 (3)C19—Fe3—C21—C2252.3 (7)
C14—Fe1—S2—Fe2−107.87 (12)C15—Fe3—C21—C2277.9 (3)
P1—Fe1—S2—Fe2155.17 (4)C20—Fe3—C21—C22−119.9 (4)
S1—Fe1—S2—Fe253.61 (3)C20—C21—C22—C230.4 (5)
C13—Fe1—P1—C23−153.80 (18)Fe3—C21—C22—C2359.8 (3)
C14—Fe1—P1—C23−61.51 (18)C20—C21—C22—Fe3−59.4 (3)
S1—Fe1—P1—C23117.07 (13)C18—Fe3—C22—C21163.4 (6)
S2—Fe1—P1—C2328.86 (14)C16—Fe3—C22—C21−78.7 (3)
Fe2—Fe1—P1—C2382.08 (15)C17—Fe3—C22—C21−44.7 (5)
C13—Fe1—P1—C2585.87 (17)C24—Fe3—C22—C2181.0 (3)
C14—Fe1—P1—C25178.16 (17)C23—Fe3—C22—C21119.3 (3)
S1—Fe1—P1—C25−3.25 (13)C19—Fe3—C22—C21−162.5 (3)
S2—Fe1—P1—C25−91.46 (13)C15—Fe3—C22—C21−121.8 (3)
Fe2—Fe1—P1—C25−38.24 (16)C20—Fe3—C22—C2136.9 (2)
C13—Fe1—P1—C31−28.89 (18)C18—Fe3—C22—C2344.1 (7)
C14—Fe1—P1—C3163.40 (18)C16—Fe3—C22—C23162.0 (2)
S1—Fe1—P1—C31−118.01 (13)C17—Fe3—C22—C23−164.0 (4)
S2—Fe1—P1—C31153.78 (13)C24—Fe3—C22—C23−38.3 (2)
Fe2—Fe1—P1—C31−153.00 (13)C21—Fe3—C22—C23−119.3 (3)
C7—C2—C3—C40.1 (6)C19—Fe3—C22—C2378.2 (3)
C1—C2—C3—C4179.4 (4)C15—Fe3—C22—C23118.9 (3)
C2—C3—C4—C5−0.9 (6)C20—Fe3—C22—C23−82.4 (2)
C3—C4—C5—C61.4 (5)C21—C22—C23—C24−0.6 (4)
C3—C4—C5—N1177.6 (3)Fe3—C22—C23—C2459.4 (2)
C9—N1—C5—C63.7 (5)C21—C22—C23—P1171.5 (3)
C8—N1—C5—C6−151.7 (3)Fe3—C22—C23—P1−128.5 (3)
C9—N1—C5—C4−172.3 (3)C21—C22—C23—Fe3−60.0 (3)
C8—N1—C5—C432.3 (5)C25—P1—C23—C24109.2 (3)
C4—C5—C6—C7−1.1 (6)C31—P1—C23—C24−146.8 (3)
N1—C5—C6—C7−177.2 (3)Fe1—P1—C23—C24−16.1 (4)
C5—C6—C7—C20.3 (6)C25—P1—C23—C22−61.3 (3)
C3—C2—C7—C60.2 (6)C31—P1—C23—C2242.6 (4)
C1—C2—C7—C6−179.0 (4)Fe1—P1—C23—C22173.3 (3)
C5—N1—C8—S298.7 (4)C25—P1—C23—Fe3−155.9 (2)
C9—N1—C8—S2−58.1 (4)C31—P1—C23—Fe3−51.9 (3)
Fe2—S2—C8—N1−20.0 (3)Fe1—P1—C23—Fe378.7 (3)
Fe1—S2—C8—N153.6 (3)C22—Fe3—C23—C24−118.2 (3)
C5—N1—C9—S1−84.2 (4)C18—Fe3—C23—C2475.4 (3)
C8—N1—C9—S173.6 (3)C16—Fe3—C23—C24−161.7 (4)
Fe1—S1—C9—N1−79.0 (3)C17—Fe3—C23—C2437.8 (6)
Fe2—S1—C9—N1−7.5 (3)C21—Fe3—C23—C24−80.8 (2)
C22—Fe3—C15—C19−126.1 (3)C19—Fe3—C23—C24118.1 (2)
C18—Fe3—C15—C1937.5 (3)C15—Fe3—C23—C24161.0 (2)
C16—Fe3—C15—C19118.4 (4)C20—Fe3—C23—C24−37.7 (2)
C17—Fe3—C15—C1981.6 (3)C18—Fe3—C23—C22−166.4 (3)
C24—Fe3—C15—C19−47.4 (6)C16—Fe3—C23—C22−43.4 (5)
C21—Fe3—C15—C19−168.2 (3)C17—Fe3—C23—C22156.0 (5)
C23—Fe3—C15—C19−82.8 (3)C24—Fe3—C23—C22118.2 (3)
C20—Fe3—C15—C19157.0 (5)C21—Fe3—C23—C2237.5 (2)
C22—Fe3—C15—C16115.5 (3)C19—Fe3—C23—C22−123.7 (3)
C18—Fe3—C15—C16−80.9 (3)C15—Fe3—C23—C22−80.8 (3)
C17—Fe3—C15—C16−36.9 (3)C20—Fe3—C23—C2280.5 (2)
C24—Fe3—C15—C16−165.8 (4)C22—Fe3—C23—P1121.1 (4)
C21—Fe3—C15—C1673.3 (4)C18—Fe3—C23—P1−45.3 (4)
C23—Fe3—C15—C16158.8 (3)C16—Fe3—C23—P177.7 (5)
C19—Fe3—C15—C16−118.4 (4)C17—Fe3—C23—P1−82.9 (6)
C20—Fe3—C15—C1638.6 (7)C24—Fe3—C23—P1−120.7 (3)
C19—C15—C16—C17−0.1 (5)C21—Fe3—C23—P1158.6 (3)
Fe3—C15—C16—C1759.8 (3)C19—Fe3—C23—P1−2.6 (3)
C19—C15—C16—Fe3−59.9 (3)C15—Fe3—C23—P140.3 (3)
C22—Fe3—C16—C17157.2 (3)C20—Fe3—C23—P1−158.4 (3)
C18—Fe3—C16—C17−37.8 (3)C22—C23—C24—C200.5 (4)
C24—Fe3—C16—C1745.4 (6)P1—C23—C24—C20−171.6 (3)
C21—Fe3—C16—C17115.7 (3)Fe3—C23—C24—C2059.5 (3)
C23—Fe3—C16—C17−171.0 (3)C22—C23—C24—Fe3−59.0 (2)
C19—Fe3—C16—C17−81.8 (3)P1—C23—C24—Fe3128.9 (3)
C15—Fe3—C16—C17−119.5 (4)C21—C20—C24—C23−0.2 (4)
C20—Fe3—C16—C1775.3 (4)Fe3—C20—C24—C23−59.4 (3)
C22—Fe3—C16—C15−83.3 (3)C21—C20—C24—Fe359.1 (3)
C18—Fe3—C16—C1581.7 (3)C22—Fe3—C24—C2338.56 (19)
C17—Fe3—C16—C15119.5 (4)C18—Fe3—C24—C23−124.9 (2)
C24—Fe3—C16—C15164.9 (4)C16—Fe3—C24—C23159.4 (5)
C21—Fe3—C16—C15−124.8 (3)C17—Fe3—C24—C23−167.2 (2)
C23—Fe3—C16—C15−51.5 (6)C21—Fe3—C24—C2382.3 (2)
C19—Fe3—C16—C1537.7 (3)C19—Fe3—C24—C23−82.6 (3)
C20—Fe3—C16—C15−165.2 (3)C15—Fe3—C24—C23−48.1 (5)
C15—C16—C17—C18−0.6 (5)C20—Fe3—C24—C23119.3 (3)
Fe3—C16—C17—C1859.1 (3)C22—Fe3—C24—C20−80.8 (2)
C15—C16—C17—Fe3−59.7 (3)C18—Fe3—C24—C20115.7 (3)
C22—Fe3—C17—C16−49.2 (6)C16—Fe3—C24—C2040.1 (6)
C18—Fe3—C17—C16119.5 (5)C17—Fe3—C24—C2073.5 (3)
C24—Fe3—C17—C16−162.6 (3)C21—Fe3—C24—C20−37.0 (2)
C21—Fe3—C17—C16−80.5 (4)C23—Fe3—C24—C20−119.3 (3)
C23—Fe3—C17—C16168.3 (5)C19—Fe3—C24—C20158.0 (3)
C19—Fe3—C17—C1681.2 (3)C15—Fe3—C24—C20−167.4 (5)
C15—Fe3—C17—C1637.8 (3)C23—P1—C25—C26176.8 (3)
C20—Fe3—C17—C16−121.8 (3)C31—P1—C25—C2669.7 (3)
C22—Fe3—C17—C18−168.7 (4)Fe1—P1—C25—C26−54.5 (3)
C16—Fe3—C17—C18−119.5 (5)C23—P1—C25—C30−6.0 (3)
C24—Fe3—C17—C1877.9 (3)C31—P1—C25—C30−113.1 (3)
C21—Fe3—C17—C18160.0 (3)Fe1—P1—C25—C30122.8 (3)
C23—Fe3—C17—C1848.8 (7)C30—C25—C26—C27−0.3 (5)
C19—Fe3—C17—C18−38.3 (3)P1—C25—C26—C27177.1 (3)
C15—Fe3—C17—C18−81.7 (3)C25—C26—C27—C280.1 (6)
C20—Fe3—C17—C18118.6 (3)C26—C27—C28—C291.2 (6)
C16—C17—C18—C191.0 (5)C27—C28—C29—C30−2.2 (6)
Fe3—C17—C18—C1960.5 (3)C28—C29—C30—C252.1 (6)
C16—C17—C18—Fe3−59.6 (3)C26—C25—C30—C29−0.8 (5)
C22—Fe3—C18—C1943.4 (8)P1—C25—C30—C29−178.0 (3)
C16—Fe3—C18—C19−81.1 (3)C23—P1—C31—C36104.2 (3)
C17—Fe3—C18—C19−118.0 (4)C25—P1—C31—C36−149.6 (3)
C24—Fe3—C18—C19120.2 (3)Fe1—P1—C31—C36−27.7 (3)
C21—Fe3—C18—C19−161.8 (4)C23—P1—C31—C32−74.4 (3)
C23—Fe3—C18—C1978.3 (3)C25—P1—C31—C3231.8 (3)
C15—Fe3—C18—C19−37.1 (3)Fe1—P1—C31—C32153.6 (3)
C20—Fe3—C18—C19163.4 (3)C36—C31—C32—C33−0.8 (6)
C22—Fe3—C18—C17161.4 (6)P1—C31—C32—C33177.8 (3)
C16—Fe3—C18—C1736.9 (3)C31—C32—C33—C340.9 (6)
C24—Fe3—C18—C17−121.8 (3)C32—C33—C34—C35−0.2 (7)
C21—Fe3—C18—C17−43.8 (6)C33—C34—C35—C36−0.4 (7)
C23—Fe3—C18—C17−163.8 (3)C32—C31—C36—C350.2 (6)
C19—Fe3—C18—C17118.0 (4)P1—C31—C36—C35−178.5 (3)
C15—Fe3—C18—C1780.9 (3)C34—C35—C36—C310.4 (6)
D—H···AD—HH···AD···AD—H···A
C22—H22···O2i0.982.533.224 (5)128
C24—H24···S20.982.723.561 (4)144
Table 1

Selected bond lengths (Å)

Fe1—C131.750 (4)
Fe1—P12.2565 (10)
Fe1—S12.2762 (11)
Fe1—S22.2818 (11)
Fe1—Fe22.5160 (8)
Fe2—C111.761 (5)
Fe2—C121.777 (5)
Fe2—C101.813 (5)
Fe2—S22.2546 (11)
Fe2—S12.2867 (11)
Table 2

Hydrogen-bond geometry (Å, °)

D—H⋯AD—HH⋯ADAD—H⋯A
C22—H22⋯O2i0.982.533.224 (5)128
C24—H24⋯S20.982.723.561 (4)144

Symmetry code: (i) .

  6 in total

1.  A short history of SHELX.

Authors:  George M Sheldrick
Journal:  Acta Crystallogr A       Date:  2007-12-21       Impact factor: 2.290

2.  Hydrogenase sophistication.

Authors:  R Cammack
Journal:  Nature       Date:  1999-01-21       Impact factor: 49.962

3.  Desulfovibrio desulfuricans iron hydrogenase: the structure shows unusual coordination to an active site Fe binuclear center.

Authors:  Y Nicolet; C Piras; P Legrand; C E Hatchikian; J C Fontecilla-Camps
Journal:  Structure       Date:  1999-01-15       Impact factor: 5.006

Review 4.  Chemistry and the hydrogenases.

Authors:  David J Evans; Christopher J Pickett
Journal:  Chem Soc Rev       Date:  2003-09       Impact factor: 54.564

5.  Model of the iron hydrogenase active site covalently linked to a ruthenium photosensitizer: synthesis and photophysical properties.

Authors:  Sascha Ott; Magnus Borgström; Mikael Kritikos; Reiner Lomoth; Jonas Bergquist; Björn Akermark; Leif Hammarström; Licheng Sun
Journal:  Inorg Chem       Date:  2004-07-26       Impact factor: 5.165

6.  X-ray crystal structure of the Fe-only hydrogenase (CpI) from Clostridium pasteurianum to 1.8 angstrom resolution.

Authors:  J W Peters; W N Lanzilotta; B J Lemon; L C Seefeldt
Journal:  Science       Date:  1998-12-04       Impact factor: 47.728

  6 in total

北京卡尤迪生物科技股份有限公司 © 2022-2023.